17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1368 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1368  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  357  3e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.75302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1304  putative transmembrane protein  94.41 
 
 		 179 aa  315  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291809  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1427  hypothetical protein  73.74 
 
 		 173 aa  233  8e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0220837  hitchhiker  0.00312062 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1858  transmembrane protein  36.42 
 
 		 201 aa  87  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1459  hypothetical protein  35.39 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.378449 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2289  putative transmembrane protein  32.97 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2002  hypothetical protein  28.66 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  0.742672 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3371  hypothetical protein  31.11 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3007  hypothetical protein  29.01 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1619  putative transmembrane protein  33.14 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2060  putative transmembrane protein  30.86 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2439  hypothetical protein  29.67 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2760  hypothetical protein  30.43 
 
 		 170 aa  51.6  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3900  hypothetical protein  31.84 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0299116 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1259  hypothetical protein  27.17 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.31261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2549  hypothetical protein  27.27 
 
 		 200 aa  48.1  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444447 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  26.67 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.310409 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>