19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2289 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2289  putative transmembrane protein  100 
 
 		 173 aa  347  6e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2002  hypothetical protein  52.05 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  0.742672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2439  hypothetical protein  52.35 
 
 		 180 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2760  hypothetical protein  49.44 
 
 		 170 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3371  hypothetical protein  46.51 
 
 		 182 aa  120  9e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2549  hypothetical protein  43.93 
 
 		 200 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444447 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1259  hypothetical protein  43.93 
 
 		 165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.31261  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3900  hypothetical protein  47.67 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0299116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3007  hypothetical protein  44.72 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1619  putative transmembrane protein  36.53 
 
 		 165 aa  97.8  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2060  putative transmembrane protein  32.93 
 
 		 181 aa  87.4  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1304  putative transmembrane protein  35.33 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1368  hypothetical protein  34.81 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.75302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  28.75 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1459  hypothetical protein  26.74 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.378449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1858  transmembrane protein  28.48 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1427  hypothetical protein  31.32 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0220837  hitchhiker  0.00312062 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2624  hypothetical protein  30.07 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2339  hypothetical protein  22.49 
 
 		 166 aa  44.7  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.134432 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>