21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2760 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2760  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  335  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2002  hypothetical protein  54.55 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  0.742672 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2289  putative transmembrane protein  50.28 
 
 		 173 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2439  hypothetical protein  51.85 
 
 		 180 aa  140  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3371  hypothetical protein  52.66 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2549  hypothetical protein  48.82 
 
 		 200 aa  118  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444447 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1259  hypothetical protein  47.65 
 
 		 165 aa  117  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.31261  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3007  hypothetical protein  47.8 
 
 		 184 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3900  hypothetical protein  51.18 
 
 		 191 aa  108  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0299116 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1619  putative transmembrane protein  40.83 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2060  putative transmembrane protein  37.06 
 
 		 181 aa  87.4  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1459  hypothetical protein  32.56 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.378449 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  30.26 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2339  hypothetical protein  28.31 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.134432 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1304  putative transmembrane protein  35.29 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1858  transmembrane protein  33.11 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1427  hypothetical protein  29.38 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0220837  hitchhiker  0.00312062 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1368  hypothetical protein  34.78 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.75302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2624  hypothetical protein  29.53 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3071  hypothetical protein  30.51 
 
 		 154 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2990  hypothetical protein  29.66 
 
 		 154 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000446281  normal  0.422538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>