59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0260 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  347  6e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  98.81 
 
 		 168 aa  344  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  98.81 
 
 		 168 aa  343  6e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  98.21 
 
 		 168 aa  342  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  78.31 
 
 		 179 aa  276  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4470  hypothetical protein  84.77 
 
 		 177 aa  266  7e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0260  hypothetical protein  76.51 
 
 		 177 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.454469  hitchhiker  0.00000127449 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3762  hypothetical protein  78.15 
 
 		 177 aa  239  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0259  hypothetical protein  77.48 
 
 		 177 aa  237  5e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328034 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  50.6 
 
 		 178 aa  184  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  48.78 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0322  hypothetical protein  55.41 
 
 		 174 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3559  hypothetical protein  50.99 
 
 		 182 aa  157  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3456  hypothetical protein  51.92 
 
 		 184 aa  153  9e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0467663  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4649  hypothetical protein  48.52 
 
 		 183 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.851642 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3928  hypothetical protein  47.68 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00586  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001906  hypothetical protein  31.64 
 
 		 193 aa  92  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661466  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0399  hypothetical protein  31.58 
 
 		 172 aa  89  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  31.52 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  31.52 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3486  hypothetical protein  30.86 
 
 		 181 aa  87.8  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.160248 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  28.72 
 
 		 196 aa  85.1  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2650  hypothetical protein  34.59 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01590  hypothetical protein  35.37 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5857  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67640  hypothetical protein  33.71 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0342  hypothetical protein  34.44 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0341  hypothetical protein  32.03 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5856  hypothetical protein  30.77 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.480656  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45870  hypothetical protein  32.87 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67650  hypothetical protein  32.67 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0768  hypothetical protein  32.92 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3260  hypothetical protein  28.77 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0244  hypothetical protein  30.51 
 
 		 199 aa  70.9  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4141  hypothetical protein  33.07 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1026  hypothetical protein  26.53 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0014  hypothetical protein  28.48 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.997944  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0355  hypothetical protein  32.35 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45880  hypothetical protein  29.03 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4820  hypothetical protein  31.43 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0356  hypothetical protein  33.58 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4819  hypothetical protein  30.22 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4142  hypothetical protein  24.83 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  26.88 
 
 		 217 aa  52  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1246  putative lipoprotein  36.62 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4894  hypothetical protein  40.68 
 
 		 140 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0501  hypothetical protein  25.79 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  41.18 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56190  hypothetical protein  40.74 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0696  hypothetical protein  38.46 
 
 		 203 aa  47.4  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  51.22 
 
 		 284 aa  44.7  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3257  hypothetical protein  38.46 
 
 		 140 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  34.83 
 
 		 298 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0184  hypothetical protein  44.44 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0976  hypothetical protein  25.82 
 
 		 272 aa  41.6  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00200448  hitchhiker  0.000161886 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  32.35 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42530  hypothetical protein  40.68 
 
 		 140 aa  41.6  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  27.13 
 
 		 156 aa  41.6  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.310409 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>