59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4470 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4470  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  364  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  83.13 
 
 		 168 aa  286  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  82.53 
 
 		 168 aa  286  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  83.13 
 
 		 168 aa  286  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  76.97 
 
 		 179 aa  285  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3762  hypothetical protein  88.7 
 
 		 177 aa  282  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0260  hypothetical protein  88.14 
 
 		 177 aa  282  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.454469  hitchhiker  0.00000127449 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  81.33 
 
 		 168 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0259  hypothetical protein  88.14 
 
 		 177 aa  280  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328034 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  49.43 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  51.14 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3559  hypothetical protein  47.2 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0322  hypothetical protein  51.3 
 
 		 174 aa  158  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3928  hypothetical protein  46.06 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4649  hypothetical protein  46.63 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.851642 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3456  hypothetical protein  46.79 
 
 		 184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0467663  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0399  hypothetical protein  32.39 
 
 		 172 aa  91.7  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  31.72 
 
 		 186 aa  91.3  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  31.72 
 
 		 186 aa  91.3  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00586  hypothetical protein  34.44 
 
 		 193 aa  91.3  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3486  hypothetical protein  29.35 
 
 		 181 aa  90.9  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.160248 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001906  hypothetical protein  32.22 
 
 		 193 aa  90.1  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661466  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01590  hypothetical protein  36.99 
 
 		 208 aa  87.8  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2650  hypothetical protein  30 
 
 		 203 aa  84.3  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  29.69 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0768  hypothetical protein  32.93 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0341  hypothetical protein  31.61 
 
 		 207 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1026  hypothetical protein  29.63 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0342  hypothetical protein  31.65 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5857  hypothetical protein  28.21 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67640  hypothetical protein  33.94 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5856  hypothetical protein  32.74 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.480656  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0244  hypothetical protein  27.13 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67650  hypothetical protein  27.33 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0355  hypothetical protein  28.48 
 
 		 210 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4141  hypothetical protein  30.71 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45870  hypothetical protein  30.07 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0356  hypothetical protein  34.53 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45880  hypothetical protein  26.95 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3260  hypothetical protein  28.1 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4820  hypothetical protein  29.5 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4819  hypothetical protein  31.39 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0014  hypothetical protein  26.14 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.997944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4142  hypothetical protein  27.04 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  25.6 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0696  hypothetical protein  43.75 
 
 		 203 aa  48.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  31.52 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4894  hypothetical protein  50 
 
 		 140 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1246  putative lipoprotein  36.67 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  47.06 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56190  hypothetical protein  28.89 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  35 
 
 		 298 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3257  hypothetical protein  40.38 
 
 		 140 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2860  hypothetical protein  55 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013794  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0184  hypothetical protein  47.22 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  37.74 
 
 		 300 aa  41.6  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0976  hypothetical protein  26.46 
 
 		 272 aa  40.8  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00200448  hitchhiker  0.000161886 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0501  hypothetical protein  23.42 
 
 		 171 aa  40.8  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510375  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>