59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0260 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0260  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  363  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.454469  hitchhiker  0.00000127449 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4470  hypothetical protein  88.14 
 
 		 177 aa  305  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3762  hypothetical protein  96.61 
 
 		 177 aa  300  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0259  hypothetical protein  96.05 
 
 		 177 aa  298  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328034 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  78.09 
 
 		 179 aa  286  9e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  80.72 
 
 		 168 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  80.12 
 
 		 168 aa  279  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  79.52 
 
 		 168 aa  276  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  78.92 
 
 		 168 aa  276  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  50.57 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  50.28 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3559  hypothetical protein  47.73 
 
 		 182 aa  167  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0322  hypothetical protein  54 
 
 		 174 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4649  hypothetical protein  46.63 
 
 		 183 aa  158  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.851642 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3928  hypothetical protein  46.49 
 
 		 181 aa  151  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3456  hypothetical protein  50 
 
 		 184 aa  147  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0467663  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  32.97 
 
 		 186 aa  94  9e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  32.97 
 
 		 186 aa  94  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00586  hypothetical protein  32.8 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0399  hypothetical protein  31.46 
 
 		 172 aa  91.7  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001906  hypothetical protein  31.87 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661466  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2650  hypothetical protein  33.14 
 
 		 203 aa  88.2  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01590  hypothetical protein  34.25 
 
 		 208 aa  84.3  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0341  hypothetical protein  32.03 
 
 		 207 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  26.74 
 
 		 196 aa  80.9  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1026  hypothetical protein  28 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3486  hypothetical protein  29.78 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.160248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5857  hypothetical protein  28.95 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67650  hypothetical protein  28.19 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0342  hypothetical protein  31.65 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0768  hypothetical protein  31.1 
 
 		 174 aa  72  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5856  hypothetical protein  30.14 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.480656  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0355  hypothetical protein  28.95 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67640  hypothetical protein  30.91 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0244  hypothetical protein  27.27 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45870  hypothetical protein  28.67 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45880  hypothetical protein  26.95 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3260  hypothetical protein  28.57 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4141  hypothetical protein  27.45 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4820  hypothetical protein  30.71 
 
 		 210 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0356  hypothetical protein  34.53 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4819  hypothetical protein  32.85 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4142  hypothetical protein  27.45 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0014  hypothetical protein  27.67 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.997944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  26.67 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4894  hypothetical protein  50 
 
 		 140 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  47.17 
 
 		 151 aa  47.8  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1246  putative lipoprotein  38.33 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3257  hypothetical protein  45.65 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  38.75 
 
 		 298 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56190  hypothetical protein  43.48 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2860  hypothetical protein  53.85 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013794  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0696  hypothetical protein  39.34 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0501  hypothetical protein  23.46 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3647  hypothetical protein  43.59 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0184  hypothetical protein  47.22 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2821  hypothetical protein  32.81 
 
 		 178 aa  41.6  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000141194  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  40.43 
 
 		 151 aa  41.6  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  46.34 
 
 		 284 aa  41.6  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>