61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3928 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3928  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  369  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  47.51 
 
 
178 aa  181  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3559  hypothetical protein  54.55 
 
 
182 aa  178  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  45.05 
 
 
179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  48.5 
 
 
168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  47.31 
 
 
168 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  46.71 
 
 
168 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  46.71 
 
 
168 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4649  hypothetical protein  48.07 
 
 
183 aa  159  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.851642 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4470  hypothetical protein  46.39 
 
 
177 aa  155  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  42.86 
 
 
178 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0260  hypothetical protein  44.57 
 
 
177 aa  147  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.454469  hitchhiker  0.00000127449 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3762  hypothetical protein  44.97 
 
 
177 aa  144  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0259  hypothetical protein  44.97 
 
 
177 aa  144  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328034 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0322  hypothetical protein  45.1 
 
 
174 aa  137  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3456  hypothetical protein  40.49 
 
 
184 aa  124  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0467663  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  32.11 
 
 
186 aa  94.4  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  32.11 
 
 
186 aa  94.4  9e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0768  hypothetical protein  31.79 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001906  hypothetical protein  35.63 
 
 
193 aa  90.9  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661466  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00586  hypothetical protein  32.95 
 
 
193 aa  90.5  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0341  hypothetical protein  32.96 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1026  hypothetical protein  30.81 
 
 
184 aa  88.6  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2650  hypothetical protein  29.95 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3486  hypothetical protein  30.72 
 
 
181 aa  87  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.160248 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0399  hypothetical protein  32.16 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0355  hypothetical protein  32.2 
 
 
210 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01590  hypothetical protein  37.84 
 
 
208 aa  85.1  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5856  hypothetical protein  30.13 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.480656  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5857  hypothetical protein  29.68 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67650  hypothetical protein  29.61 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4820  hypothetical protein  29.63 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  26.6 
 
 
196 aa  77.8  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45880  hypothetical protein  30.46 
 
 
203 aa  77  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4142  hypothetical protein  29.38 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3260  hypothetical protein  28.08 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45870  hypothetical protein  31.58 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67640  hypothetical protein  28.21 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  26.54 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4141  hypothetical protein  28.21 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4819  hypothetical protein  31.29 
 
 
193 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0244  hypothetical protein  26.29 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0014  hypothetical protein  25.49 
 
 
175 aa  63.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.997944  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0356  hypothetical protein  29.53 
 
 
180 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0342  hypothetical protein  27.52 
 
 
169 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0501  hypothetical protein  27.27 
 
 
171 aa  55.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510375  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3257  hypothetical protein  48.84 
 
 
140 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1246  putative lipoprotein  43.64 
 
 
147 aa  48.5  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0696  hypothetical protein  38.04 
 
 
203 aa  46.2  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56190  hypothetical protein  45.65 
 
 
140 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2502  hypothetical protein  50 
 
 
154 aa  45.1  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4894  hypothetical protein  47.83 
 
 
140 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  41.27 
 
 
151 aa  45.1  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  45.71 
 
 
211 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42530  hypothetical protein  28.57 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3647  hypothetical protein  37.1 
 
 
162 aa  42.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  45 
 
 
144 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3301  hypothetical protein  32.2 
 
 
145 aa  42  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  42 
 
 
158 aa  42  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2958  hypothetical protein  75 
 
 
312 aa  42  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0851  hypothetical protein  80.95 
 
 
544 aa  41.6  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>