48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4141 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4141  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0342  hypothetical protein  62.18 
 
 		 169 aa  192  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4819  hypothetical protein  59.01 
 
 		 193 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0356  hypothetical protein  56.89 
 
 		 180 aa  187  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5856  hypothetical protein  56.47 
 
 		 173 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.480656  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67640  hypothetical protein  55.03 
 
 		 173 aa  170  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45870  hypothetical protein  54.3 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67650  hypothetical protein  39.1 
 
 		 190 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3260  hypothetical protein  42.11 
 
 		 174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5857  hypothetical protein  37.97 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0355  hypothetical protein  41.99 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0341  hypothetical protein  38.33 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4142  hypothetical protein  35.19 
 
 		 206 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45880  hypothetical protein  38.69 
 
 		 203 aa  95.5  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4820  hypothetical protein  39.24 
 
 		 210 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  31.11 
 
 		 178 aa  90.9  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  35.71 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  35.71 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0244  hypothetical protein  32.78 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  32.78 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0768  hypothetical protein  28.92 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  33.52 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  32.88 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  32.88 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  32.88 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  32.88 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0399  hypothetical protein  27.84 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00586  hypothetical protein  30.6 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3456  hypothetical protein  32.26 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0467663  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3559  hypothetical protein  31.11 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001906  hypothetical protein  30.22 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661466  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4470  hypothetical protein  31.3 
 
 		 177 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3928  hypothetical protein  28.74 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4649  hypothetical protein  31.65 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.851642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3762  hypothetical protein  27.91 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0260  hypothetical protein  27.33 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.454469  hitchhiker  0.00000127449 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0259  hypothetical protein  27.33 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328034 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2650  hypothetical protein  33.72 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  26.42 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0322  hypothetical protein  30.63 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  28.08 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0014  hypothetical protein  33.76 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.997944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3486  hypothetical protein  22.62 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.160248 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1508  hypothetical protein  47.92 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0660289  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0501  hypothetical protein  25.44 
 
 		 171 aa  45.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3301  hypothetical protein  43.14 
 
 		 145 aa  45.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1247  M23/37 family peptidase  32.5 
 
 		 297 aa  44.7  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2502  hypothetical protein  46.67 
 
 		 154 aa  43.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>