More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1247 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1247  M23/37 family peptidase  100 
 
 		 297 aa  617  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.28 
 
 		 309 aa  181  9.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  36.36 
 
 		 298 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  34.83 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  36.7 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  36.53 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  36.18 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  35.62 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  31.05 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  30.95 
 
 		 300 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  31.16 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  31.16 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  31.16 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  34.32 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1987  peptidase  34.32 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  36.59 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3052  Peptidase M23  35.71 
 
 		 297 aa  115  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.346381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03923  peptidase M23B  36.48 
 
 		 293 aa  108  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0458107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1689  peptidase M23B  28.1 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.708737  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11888  hypothetical protein  32.6 
 
 		 277 aa  92  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.298179  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  33.56 
 
 		 995 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0031  M24/M37 family peptidase  37.39 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  33.33 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  35.11 
 
 		 550 aa  69.7  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2268  Peptidase M23  36.52 
 
 		 344 aa  68.9  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  31.91 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  34.04 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  32.79 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  32.93 
 
 		 446 aa  66.2  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  32.23 
 
 		 198 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  32.23 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  39.18 
 
 		 751 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  32.5 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31778  predicted protein  33.33 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  35 
 
 		 727 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  35 
 
 		 727 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2596  Peptidase M23  28.87 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  33.33 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  36.61 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4243  Peptidase M23  28.87 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0737  Peptidase M23  36.36 
 
 		 580 aa  63.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.200765  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  28.71 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  36.36 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  29.59 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  32.5 
 
 		 245 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  36.21 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  30.61 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  28.99 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.78 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  30.63 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  32.64 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  37.37 
 
 		 754 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  35.05 
 
 		 590 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  33.33 
 
 		 538 aa  60.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  36.08 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  33.07 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  32.59 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  35.42 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  40 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  36.17 
 
 		 824 aa  59.7  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  32.54 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.26 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  29.03 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1837  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  34.15 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.396478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  38.14 
 
 		 375 aa  59.3  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  36.28 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  32.54 
 
 		 386 aa  59.3  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  32.54 
 
 		 386 aa  58.9  0.00000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  28.86 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  25.68 
 
 		 411 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  38.14 
 
 		 469 aa  58.9  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  33.33 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  29.8 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  33.91 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  25.85 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0307  Peptidase M23  32.06 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000988851  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  30.82 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  30.43 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  27.37 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  35 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  27.6 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  29.41 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  40.86 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0696  Peptidase M23  29.14 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  34.11 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  34.11 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  34.11 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  27.94 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  29.63 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  34.69 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  37.37 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  33.33 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  35.05 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  34.11 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  34.11 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.38 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  34.11 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  38.38 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  34.11 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  35.48 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>