48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4820 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4820  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  430  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0355  hypothetical protein  90 
 
 		 210 aa  377  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0341  hypothetical protein  64.42 
 
 		 207 aa  258  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4142  hypothetical protein  62.77 
 
 		 206 aa  238  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45880  hypothetical protein  48.78 
 
 		 203 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5857  hypothetical protein  58.6 
 
 		 190 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67650  hypothetical protein  58.71 
 
 		 190 aa  167  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4141  hypothetical protein  38.56 
 
 		 188 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2650  hypothetical protein  30.77 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5856  hypothetical protein  35.8 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.480656  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67640  hypothetical protein  36.36 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0768  hypothetical protein  30.54 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3486  hypothetical protein  30.23 
 
 		 181 aa  80.9  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.160248 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  28.49 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3260  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0244  hypothetical protein  30.46 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3928  hypothetical protein  29.38 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4819  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3559  hypothetical protein  31.9 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  29.89 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0356  hypothetical protein  31.1 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  29.01 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  29.01 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0342  hypothetical protein  33.91 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45870  hypothetical protein  34.21 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  31.61 
 
 		 168 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  31.61 
 
 		 168 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  31.61 
 
 		 168 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  30.97 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4649  hypothetical protein  27.15 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.851642 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  28.39 
 
 		 179 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0399  hypothetical protein  26.86 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  27.12 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0322  hypothetical protein  30.66 
 
 		 174 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3456  hypothetical protein  31.69 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0467663  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4470  hypothetical protein  31.82 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0260  hypothetical protein  28.57 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.454469  hitchhiker  0.00000127449 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3762  hypothetical protein  28.57 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0259  hypothetical protein  28.57 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328034 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  25.91 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1026  hypothetical protein  23.08 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0014  hypothetical protein  30.13 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.997944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001906  hypothetical protein  25.29 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661466  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00586  hypothetical protein  26.55 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01590  hypothetical protein  28.48 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0501  hypothetical protein  23.95 
 
 		 171 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2502  hypothetical protein  45.24 
 
 		 154 aa  42.4  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0976  hypothetical protein  23.6 
 
 		 272 aa  41.2  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00200448  hitchhiker  0.000161886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>