More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0185 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  100 
 
 		 298 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  77.09 
 
 		 299 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  76.73 
 
 		 299 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  62.7 
 
 		 319 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  62.37 
 
 		 298 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  62.21 
 
 		 300 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  64.42 
 
 		 268 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  56.8 
 
 		 300 aa  350  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  57.38 
 
 		 298 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  57.05 
 
 		 298 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  56.71 
 
 		 298 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.41 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1247  M23/37 family peptidase  36.18 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  39.91 
 
 		 290 aa  144  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1987  peptidase  39.45 
 
 		 290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  48.41 
 
 		 281 aa  139  7.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1689  peptidase M23B  35.42 
 
 		 261 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.708737  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3052  Peptidase M23  37.21 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.346381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03923  peptidase M23B  46.21 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0458107  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11888  hypothetical protein  39.06 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.298179  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  34.38 
 
 		 995 aa  83.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05623  hypothetical protein  39.29 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  41.79 
 
 		 550 aa  79.3  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  44.66 
 
 		 751 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  45.56 
 
 		 824 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  34.73 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  36.64 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  42.72 
 
 		 590 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  39.32 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4533  Peptidase M23  35.43 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  48.48 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  40 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  47.42 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  40 
 
 		 538 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  43.12 
 
 		 452 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000457  peptidase M23  35.29 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  44.55 
 
 		 727 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  44.55 
 
 		 727 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  40.95 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  43.01 
 
 		 490 aa  73.2  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  38.81 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  40.8 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  40.58 
 
 		 423 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  43.3 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  47.31 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  45.16 
 
 		 351 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  41.59 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  44.09 
 
 		 509 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  37.14 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  35.22 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  32.82 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  37.14 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  37.39 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  47.87 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  41.9 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  46.15 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  37.29 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  43.36 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  44 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  46.15 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  38.94 
 
 		 486 aa  69.7  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  40.57 
 
 		 582 aa  69.3  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  36.57 
 
 		 443 aa  69.3  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  38.71 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  42.39 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  42.72 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  29.65 
 
 		 376 aa  68.9  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  45.05 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  39.82 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  39.82 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  43.14 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  39.82 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  39.82 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  44.09 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  43.01 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  36.48 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  46.74 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  36.15 
 
 		 454 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  46.67 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  39.82 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  39.82 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  37.23 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  46.24 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  46.67 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  39.82 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  39.82 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  40.71 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  39.82 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  46.67 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  43.01 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  39.34 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  43.27 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  46.81 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  35.83 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  48.35 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  40.62 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  39.66 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1270  Peptidase M23  41.75 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.71077  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  38.94 
 
 		 439 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  41.67 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>