40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2593 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2593  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  320  4e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3706  hypothetical protein  32.76 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2339  hypothetical protein  26.99 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.134432 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  27.81 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42530  hypothetical protein  30.72 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  26.8 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  26.14 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  25.66 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  32.58 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3257  hypothetical protein  29.93 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1127  hypothetical protein  34.53 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0795312  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2624  hypothetical protein  25.87 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4789  hypothetical protein  29.22 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0307864  hitchhiker  0.00167919 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1122  hypothetical protein  25.62 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000205985  normal  0.233923 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3301  hypothetical protein  34.23 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3269  hypothetical protein  25.62 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575849  normal  0.0306422 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1619  putative transmembrane protein  27.04 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1020  hypothetical protein  25.77 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000462608  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1427  hypothetical protein  27.06 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0220837  hitchhiker  0.00312062 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2060  putative transmembrane protein  27.56 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1025  hypothetical protein  27.56 
 
 		 155 aa  47.4  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000544137  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1089  hypothetical protein  25.15 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000360525  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5412  hypothetical protein  27.52 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0184  hypothetical protein  37.36 
 
 		 194 aa  45.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2487  hypothetical protein  32.73 
 
 		 212 aa  45.1  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2002  hypothetical protein  24.71 
 
 		 206 aa  44.7  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  0.742672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4894  hypothetical protein  33.58 
 
 		 140 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  40.32 
 
 		 217 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1508  hypothetical protein  35.42 
 
 		 163 aa  43.9  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0660289  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1246  putative lipoprotein  24.6 
 
 		 147 aa  43.9  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3371  hypothetical protein  36.67 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56190  hypothetical protein  33.85 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2860  hypothetical protein  25.15 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013794  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2739  hypothetical protein  47.37 
 
 		 342 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62170  hypothetical protein  26.62 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.157561 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2502  hypothetical protein  43.75 
 
 		 154 aa  42  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  23.21 
 
 		 186 aa  41.2  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  23.21 
 
 		 186 aa  41.2  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2439  hypothetical protein  22.87 
 
 		 180 aa  41.2  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1156  hypothetical protein  51.72 
 
 		 176 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>