32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3576 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3576  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  316  7.999999999999999e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3071  hypothetical protein  79.22 
 
 		 154 aa  257  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3168  hypothetical protein  79.22 
 
 		 154 aa  256  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000633672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2990  hypothetical protein  77.92 
 
 		 154 aa  254  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000446281  normal  0.422538 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1122  hypothetical protein  63.23 
 
 		 155 aa  197  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000205985  normal  0.233923 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1020  hypothetical protein  63.23 
 
 		 155 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000462608  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1089  hypothetical protein  62.58 
 
 		 155 aa  196  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000360525  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3269  hypothetical protein  61.94 
 
 		 155 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575849  normal  0.0306422 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1025  hypothetical protein  59.35 
 
 		 155 aa  191  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000544137  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2860  hypothetical protein  54.23 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013794  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  50.65 
 
 		 151 aa  143  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0670  hypothetical protein  51.11 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00376699  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3162  hypothetical protein  52.27 
 
 		 187 aa  135  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000326454  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  44.68 
 
 		 151 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3719  hypothetical protein  47.01 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000989384  normal  0.0383104 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3496  hypothetical protein  46.43 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00242449  hitchhiker  0.00393071 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1728  hypothetical protein  28.57 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1795  hypothetical protein  28.57 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4789  hypothetical protein  29.53 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0307864  hitchhiker  0.00167919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  28 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42530  hypothetical protein  25.83 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3912  hypothetical protein  25.29 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1127  hypothetical protein  28.37 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0795312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62170  hypothetical protein  30.08 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.157561 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0845  hypothetical protein  32.28 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  26.4 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5412  hypothetical protein  28.06 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0980  hypothetical protein  30.16 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0851  hypothetical protein  57.14 
 
 		 544 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  38.18 
 
 		 196 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1508  hypothetical protein  30.14 
 
 		 163 aa  40.4  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0660289  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0636  hypothetical protein  44.64 
 
 		 155 aa  40.4  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00424939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>