23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03187 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03187  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  267  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1795  hypothetical protein  46.55 
 
 
125 aa  103  8e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1728  hypothetical protein  46.55 
 
 
125 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0528  hypothetical protein  51.49 
 
 
124 aa  87.8  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485368  normal  0.376375 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  28.47 
 
 
151 aa  54.3  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  34.29 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0845  hypothetical protein  28.12 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56190  hypothetical protein  31.3 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3168  hypothetical protein  26.61 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000633672  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3719  hypothetical protein  27.48 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000989384  normal  0.0383104 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3576  hypothetical protein  28.91 
 
 
154 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2990  hypothetical protein  25.41 
 
 
154 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000446281  normal  0.422538 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  26.51 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0105  hypothetical protein  48.57 
 
 
207 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207531  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3071  hypothetical protein  25.41 
 
 
154 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110904  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0980  hypothetical protein  28.12 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  52.78 
 
 
151 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4789  hypothetical protein  50 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0307864  hitchhiker  0.00167919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4894  hypothetical protein  53.57 
 
 
140 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  32.61 
 
 
214 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0636  hypothetical protein  42.86 
 
 
155 aa  40.4  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00424939  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  45.95 
 
 
144 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3301  hypothetical protein  29.69 
 
 
145 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>