31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0636 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0636  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  317  5e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00424939  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  27.92 
 
 
144 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  29.49 
 
 
158 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3912  hypothetical protein  29.8 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  29.2 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3168  hypothetical protein  31.06 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000633672  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42530  hypothetical protein  26.35 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5412  hypothetical protein  29.85 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  30.89 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3576  hypothetical protein  35.09 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62170  hypothetical protein  29.01 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.157561 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3301  hypothetical protein  29.06 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4789  hypothetical protein  30.3 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0307864  hitchhiker  0.00167919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2990  hypothetical protein  30.15 
 
 
154 aa  44.3  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000446281  normal  0.422538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1020  hypothetical protein  30.53 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000462608  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1089  hypothetical protein  30 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000360525  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3071  hypothetical protein  30.3 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110904  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0526  hypothetical protein  24.68 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.182831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0980  hypothetical protein  28.8 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0521  hypothetical protein  26.14 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759157 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  46.81 
 
 
168 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  46.81 
 
 
168 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1025  hypothetical protein  27.82 
 
 
155 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000544137  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3269  hypothetical protein  29.77 
 
 
155 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575849  normal  0.0306422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2546  hypothetical protein  27.33 
 
 
147 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0786863  hitchhiker  0.000802946 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1246  putative lipoprotein  30.51 
 
 
147 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  44.68 
 
 
168 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  44.68 
 
 
168 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03187  hypothetical protein  38.1 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1122  hypothetical protein  29.77 
 
 
155 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000205985  normal  0.233923 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2860  hypothetical protein  37.5 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>