48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0105 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0105  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207531  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2996  hypothetical protein  28.37 
 
 		 231 aa  88.6  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.522743  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2739  hypothetical protein  30.61 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0184  hypothetical protein  41.23 
 
 		 194 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3673  hypothetical protein  29.03 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0798405  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2487  hypothetical protein  26.05 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0181  hypothetical protein  26.44 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0488786  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0114  hypothetical protein  28.57 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0545  ABC transporter ATPase  27.88 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0087  hypothetical protein  28.29 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.518244 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0129  hypothetical protein  27.06 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.253848  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6105  hypothetical protein  30.82 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70360  hypothetical protein  29.53 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4382  hypothetical protein  28.42 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0993659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0256  hypothetical protein  29.12 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  45 
 
 		 144 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03187  hypothetical protein  45.24 
 
 		 134 aa  49.3  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0217  hypothetical protein  26.71 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0279  hypothetical protein  25.84 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00278726  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02931  hypothetical protein  30.33 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439598  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1617  hypothetical protein  24.1 
 
 		 229 aa  45.4  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.915111  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  28.97 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2047  hypothetical protein  31.36 
 
 		 177 aa  45.1  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144748  hitchhiker  0.000000493241 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4048  hypothetical protein  28.64 
 
 		 223 aa  45.1  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361653 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  34.02 
 
 		 156 aa  45.1  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3301  hypothetical protein  35.06 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42530  hypothetical protein  40.54 
 
 		 140 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0169  hypothetical protein  26.97 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0235  hypothetical protein  27.96 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0229  hypothetical protein  27.96 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  41.03 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  48.15 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  48.15 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0851  hypothetical protein  60 
 
 		 544 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2821  hypothetical protein  46.34 
 
 		 178 aa  43.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000141194  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  41.18 
 
 		 151 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1799  hypothetical protein  53.33 
 
 		 253 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.627108  normal  0.339394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56190  hypothetical protein  40.24 
 
 		 140 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2339  hypothetical protein  23.08 
 
 		 166 aa  42.4  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.134432 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4894  hypothetical protein  40.82 
 
 		 140 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  41.03 
 
 		 158 aa  42  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1508  hypothetical protein  42.86 
 
 		 163 aa  42  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0660289  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  44.74 
 
 		 217 aa  42  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1286  hypothetical protein  61.9 
 
 		 146 aa  42  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1995  hypothetical protein  38.46 
 
 		 242 aa  41.6  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000089433  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  37.21 
 
 		 168 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  37.21 
 
 		 168 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  37.21 
 
 		 168 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>