14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4382 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4382  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0993659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70360  hypothetical protein  61.93 
 
 		 205 aa  225  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6105  hypothetical protein  60.41 
 
 		 205 aa  218  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0081  hypothetical protein  54.55 
 
 		 210 aa  201  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0217  hypothetical protein  53.16 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0545  ABC transporter ATPase  34.87 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3673  hypothetical protein  39.51 
 
 		 216 aa  98.6  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0798405  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2996  hypothetical protein  30.61 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.522743  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0256  hypothetical protein  29.05 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0181  hypothetical protein  27.03 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0488786  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0184  hypothetical protein  30.16 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2739  hypothetical protein  26.92 
 
 		 342 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0121  hypothetical protein  25 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0105  hypothetical protein  28.33 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>