14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0181 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0181  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  458  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0488786  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2996  hypothetical protein  35.45 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.522743  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0105  hypothetical protein  28.02 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207531  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0545  ABC transporter ATPase  24.65 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4382  hypothetical protein  28.57 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0993659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6105  hypothetical protein  30 
 
 
205 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70360  hypothetical protein  27.09 
 
 
205 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0081  hypothetical protein  25.47 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  34.15 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0217  hypothetical protein  26.97 
 
 
210 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2739  hypothetical protein  24.17 
 
 
342 aa  45.8  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3673  hypothetical protein  27.72 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0798405  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0687  hypothetical protein  34.69 
 
 
224 aa  43.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2487  hypothetical protein  21.88 
 
 
212 aa  41.6  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>