16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0545 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0545  ABC transporter ATPase  100 
 
 
215 aa  432  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4382  hypothetical protein  35.33 
 
 
200 aa  112  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0993659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0081  hypothetical protein  31.44 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2996  hypothetical protein  31.44 
 
 
231 aa  95.9  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.522743  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70360  hypothetical protein  30.39 
 
 
205 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0217  hypothetical protein  32 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6105  hypothetical protein  31.96 
 
 
205 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3673  hypothetical protein  30.53 
 
 
216 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0798405  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2739  hypothetical protein  27.8 
 
 
342 aa  63.2  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0121  hypothetical protein  25.58 
 
 
215 aa  51.6  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0181  hypothetical protein  26.05 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0488786  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0105  hypothetical protein  27.51 
 
 
207 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207531  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0256  hypothetical protein  24.29 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0687  hypothetical protein  28.29 
 
 
224 aa  45.4  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0184  hypothetical protein  36.23 
 
 
194 aa  45.4  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4048  hypothetical protein  30.97 
 
 
223 aa  41.6  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>