17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0121 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0121  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0687  hypothetical protein  31.34 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0087  hypothetical protein  28.5 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.518244 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1617  hypothetical protein  27.12 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.915111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0169  hypothetical protein  27.04 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0218  hypothetical protein  30.53 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0229  hypothetical protein  27.91 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0235  hypothetical protein  27.91 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4048  hypothetical protein  28.04 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361653 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3927  hypothetical protein  25 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0545  ABC transporter ATPase  26.56 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2487  hypothetical protein  25.68 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0279  hypothetical protein  25.56 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00278726  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0114  hypothetical protein  29.67 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0129  hypothetical protein  29.67 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.253848  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0341  hypothetical protein  33.8 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4382  hypothetical protein  24.48 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0993659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>