14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0229 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0235  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  473  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0229  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0290  hypothetical protein  66.49 
 
 		 229 aa  228  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0218  hypothetical protein  48.24 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0169  hypothetical protein  48.77 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0341  hypothetical protein  55.02 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1617  hypothetical protein  43.06 
 
 		 229 aa  175  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.915111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0279  hypothetical protein  48.91 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00278726  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3927  hypothetical protein  47.19 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0087  hypothetical protein  42.08 
 
 		 237 aa  148  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.518244 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4048  hypothetical protein  42.45 
 
 		 223 aa  144  9e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0121  hypothetical protein  27.91 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0105  hypothetical protein  29.12 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207531  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0687  hypothetical protein  27.8 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>