13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0169 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0169  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357305  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0218  hypothetical protein  70.87 
 
 
230 aa  286  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0279  hypothetical protein  58.99 
 
 
228 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00278726  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3927  hypothetical protein  52.45 
 
 
220 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0290  hypothetical protein  51.81 
 
 
229 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0235  hypothetical protein  48.77 
 
 
238 aa  168  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999031  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0229  hypothetical protein  48.77 
 
 
238 aa  168  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1617  hypothetical protein  44.13 
 
 
229 aa  150  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.915111  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4048  hypothetical protein  43 
 
 
223 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0341  hypothetical protein  50.54 
 
 
222 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0087  hypothetical protein  42.18 
 
 
237 aa  142  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.518244 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0121  hypothetical protein  26.8 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0687  hypothetical protein  30.53 
 
 
224 aa  49.7  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>