14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3927 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3927  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  447  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0218  hypothetical protein  53.96 
 
 		 230 aa  208  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0279  hypothetical protein  53.96 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00278726  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0169  hypothetical protein  56.35 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0290  hypothetical protein  58.03 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0341  hypothetical protein  52.48 
 
 		 222 aa  165  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0235  hypothetical protein  47.22 
 
 		 238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0229  hypothetical protein  47.22 
 
 		 238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1617  hypothetical protein  40.59 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.915111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0087  hypothetical protein  42.2 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.518244 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4048  hypothetical protein  41.26 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361653 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0687  hypothetical protein  30.66 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0121  hypothetical protein  25 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0279  diguanylate cyclase  39.44 
 
 		 554 aa  42.4  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171809  normal  0.0530924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>