13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0218 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0218  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  457  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0169  hypothetical protein  71 
 
 		 223 aa  276  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3927  hypothetical protein  58.43 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0279  hypothetical protein  53.06 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00278726  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0290  hypothetical protein  52.88 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0235  hypothetical protein  50.54 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0229  hypothetical protein  50.54 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1617  hypothetical protein  44.39 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.915111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0341  hypothetical protein  48.28 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4048  hypothetical protein  42.38 
 
 		 223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361653 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0087  hypothetical protein  41.74 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.518244 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0121  hypothetical protein  28.28 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0687  hypothetical protein  32.29 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>