14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0087 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0087  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  475  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.518244 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4048  hypothetical protein  52.82 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361653 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3927  hypothetical protein  42.4 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0218  hypothetical protein  42.23 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0169  hypothetical protein  44.02 
 
 		 223 aa  142  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0235  hypothetical protein  43.28 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0229  hypothetical protein  43.28 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0279  hypothetical protein  41.85 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00278726  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0290  hypothetical protein  41.97 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1617  hypothetical protein  36.46 
 
 		 229 aa  118  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.915111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0341  hypothetical protein  38.81 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0121  hypothetical protein  29.17 
 
 		 215 aa  72  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0105  hypothetical protein  29.28 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207531  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2996  hypothetical protein  25.12 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.522743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>