14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0341 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0341  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  442  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0290  hypothetical protein  62.84 
 
 		 229 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0235  hypothetical protein  60.32 
 
 		 238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0229  hypothetical protein  60.32 
 
 		 238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3927  hypothetical protein  52.74 
 
 		 220 aa  192  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0279  hypothetical protein  55 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00278726  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0218  hypothetical protein  50.49 
 
 		 230 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0169  hypothetical protein  50 
 
 		 223 aa  169  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1617  hypothetical protein  46.7 
 
 		 229 aa  167  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.915111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0087  hypothetical protein  41.53 
 
 		 237 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.518244 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4048  hypothetical protein  38.28 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0121  hypothetical protein  31.12 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0687  hypothetical protein  31.61 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0105  hypothetical protein  23.89 
 
 		 207 aa  41.6  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>