17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2996 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2996  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  464  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.522743  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0545  ABC transporter ATPase  29.9 
 
 
215 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0105  hypothetical protein  30.34 
 
 
207 aa  79  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207531  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4382  hypothetical protein  30.22 
 
 
200 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0993659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0081  hypothetical protein  29.61 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2739  hypothetical protein  28.71 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3673  hypothetical protein  27.88 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0798405  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0217  hypothetical protein  27.67 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02931  hypothetical protein  26.88 
 
 
203 aa  62  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439598  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70360  hypothetical protein  27.65 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6105  hypothetical protein  27.19 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0114  hypothetical protein  26.19 
 
 
223 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0129  hypothetical protein  26.07 
 
 
225 aa  58.9  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.253848  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0181  hypothetical protein  33.33 
 
 
221 aa  55.5  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0488786  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2487  hypothetical protein  21.76 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0293  hypothetical protein  23.85 
 
 
220 aa  46.2  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.10736 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0087  hypothetical protein  25.12 
 
 
237 aa  42.4  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.518244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>