12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3673 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3673  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0798405  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4382  hypothetical protein  40.74 
 
 		 200 aa  112  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0993659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6105  hypothetical protein  33.88 
 
 		 205 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70360  hypothetical protein  39.74 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0081  hypothetical protein  36.08 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0217  hypothetical protein  32.93 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0545  ABC transporter ATPase  30.53 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2996  hypothetical protein  27.88 
 
 		 231 aa  87.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.522743  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0105  hypothetical protein  28.9 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207531  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2739  hypothetical protein  25.82 
 
 		 342 aa  53.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0687  hypothetical protein  25 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2487  hypothetical protein  20 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>