14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_70360 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_70360  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6105  hypothetical protein  92.68 
 
 
205 aa  351  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4382  hypothetical protein  65.7 
 
 
200 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0993659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0217  hypothetical protein  55.67 
 
 
210 aa  207  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0081  hypothetical protein  54.87 
 
 
210 aa  204  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3673  hypothetical protein  37.23 
 
 
216 aa  89.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0798405  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0545  ABC transporter ATPase  29.9 
 
 
215 aa  90.5  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2996  hypothetical protein  29.03 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.522743  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0256  hypothetical protein  28.81 
 
 
215 aa  55.8  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0181  hypothetical protein  28.89 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0488786  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0105  hypothetical protein  31.36 
 
 
207 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207531  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0121  hypothetical protein  28.4 
 
 
215 aa  42.4  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2487  hypothetical protein  25 
 
 
212 aa  42.4  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0687  hypothetical protein  28.93 
 
 
224 aa  42.4  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>