101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1155 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  100 
 
 		 123 aa  248  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  69.84 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  58.54 
 
 		 125 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  54.47 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  54.03 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  39.47 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2812  glutaredoxin family protein  34.02 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0889237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  38.75 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  37.66 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  41.33 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  41.33 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  32.11 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2230  glutaredoxin  36.36 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.381794  normal  0.448349 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  31.48 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  45.45 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  40.62 
 
 		 398 aa  57.8  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  44.93 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  38.89 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  38.81 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  38.81 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  37.5 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2919  glutaredoxin  29.03 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608309 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  37.68 
 
 		 391 aa  54.3  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  36.11 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  36.84 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  32.61 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  39.47 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003681  glutaredoxin  39.74 
 
 		 76 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  40.91 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  40.91 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  37.88 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  41.54 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  30.59 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  31.17 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  36.84 
 
 		 75 aa  50.4  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  30.53 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2237  hypothetical protein  29.63 
 
 		 126 aa  50.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  35.71 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  30.67 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  36.07 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02143  glutaredoxin  37.33 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  31.58 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  33.33 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  35.53 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  35.53 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0292  glutaredoxin  33.33 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  30.77 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  26.67 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3164  hypothetical protein  30.3 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.613757  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  36.07 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  30.99 
 
 		 384 aa  47  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  33.78 
 
 		 86 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  34.85 
 
 		 194 aa  46.2  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  36.07 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  39.71 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1223  putative glutaredoxin  36 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  29.85 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  34.85 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  32.88 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  28 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  30.14 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  28.95 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  32.31 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  31.51 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  34.43 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  31.51 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  27.16 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01340  glutathione transferase, putative  33.73 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  38.46 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  26.56 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  31.08 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  31.08 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  32.73 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  32.81 
 
 		 84 aa  42  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  35.38 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  28.81 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1542  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.458759  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  40.32 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  32.81 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  34.43 
 
 		 86 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2400  glutaredoxin, GrxC  31.65 
 
 		 87 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  26.79 
 
 		 159 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  31.82 
 
 		 88 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1149  glutaredoxin family protein  30.67 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01245  hypothetical protein  26.32 
 
 		 113 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  32 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  33.87 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  28.77 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  33.33 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3897  glutaredoxin family protein  30.67 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4201  glutaredoxin family protein  30.67 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2615  glutaredoxin  34.29 
 
 		 229 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2689  YruB family glutaredoxin-like protein  29.33 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  32.39 
 
 		 383 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2157  glutaredoxin  34.72 
 
 		 213 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3815  YruB family glutaredoxin-like protein  28.38 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  27.42 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2133  glutaredoxin family protein  34.85 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2434  hypothetical protein  26.58 
 
 		 179 aa  40.4  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.332001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3239  glutaredoxin  30.77 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0851867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>