263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0034 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  100 
 
 
81 aa  168  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  64.94 
 
 
80 aa  117  6e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  62.03 
 
 
84 aa  110  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  64.47 
 
 
84 aa  110  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  58.97 
 
 
80 aa  109  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  58.97 
 
 
80 aa  107  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  58.67 
 
 
194 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  57.69 
 
 
80 aa  105  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  52.56 
 
 
80 aa  105  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  56 
 
 
76 aa  103  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  54.93 
 
 
75 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  54.93 
 
 
75 aa  94.7  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  51.32 
 
 
80 aa  93.2  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  52.78 
 
 
175 aa  88.6  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  47.3 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  45.21 
 
 
77 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  45.83 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  39.73 
 
 
384 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  47.22 
 
 
391 aa  73.9  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  37.33 
 
 
78 aa  73.9  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  40.85 
 
 
383 aa  72  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  43.24 
 
 
76 aa  72  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  45.07 
 
 
402 aa  70.5  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  37.14 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  39.19 
 
 
82 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  46.38 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0113  glutaredoxin  40.3 
 
 
87 aa  60.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  37.97 
 
 
92 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  37.33 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  35 
 
 
90 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  40.96 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  36.49 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1784  glutaredoxin and related proteins  35.09 
 
 
59 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  35.9 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  39.44 
 
 
88 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  38.67 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  32.5 
 
 
78 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  42.86 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  33.33 
 
 
116 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  35.82 
 
 
77 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  35.82 
 
 
77 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3897  glutaredoxin family protein  30.26 
 
 
78 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4201  glutaredoxin family protein  30.26 
 
 
78 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  36 
 
 
121 aa  53.5  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  38.46 
 
 
84 aa  52.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  29.49 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  36.36 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1149  glutaredoxin family protein  28.95 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3815  YruB family glutaredoxin-like protein  27.63 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3745  glutaredoxin family protein  30.26 
 
 
78 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1319  hypothetical protein  34.33 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228979  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4091  glutaredoxin family protein  28.95 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  38.46 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  38.46 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4003  glutaredoxin family protein  28.95 
 
 
78 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  40 
 
 
85 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4037  glutaredoxin family protein  28.95 
 
 
78 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3729  glutaredoxin family protein  28.95 
 
 
78 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4108  glutaredoxin family protein  28.95 
 
 
78 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  37.31 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  32.5 
 
 
82 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  32.5 
 
 
82 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  32.5 
 
 
82 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  31.71 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  36.36 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  36.36 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2081  glutaredoxin  39.68 
 
 
74 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  35.94 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4052  glutaredoxin  34.15 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2230  glutaredoxin  35.62 
 
 
87 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.381794  normal  0.448349 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3239  glutaredoxin  32.39 
 
 
87 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0851867  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  35.38 
 
 
86 aa  50.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  35.06 
 
 
85 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  38.46 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.8 
 
 
459 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  32.81 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  35.38 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  36.92 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  32.81 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  36.49 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  36.92 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  32.81 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  30.77 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  34.15 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  36.25 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  36.49 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  32.81 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  32.81 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  32.81 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  36.49 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  38.46 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  35 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2689  YruB family glutaredoxin-like protein  25 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  33.75 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  32.88 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2866  glutaredoxin 3  36.36 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  35 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  35 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  35 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  35 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>