95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2081 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2081  glutaredoxin  100 
 
 
74 aa  149  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2396  glutaredoxin  49.25 
 
 
71 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.119438  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  47.27 
 
 
82 aa  57.8  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  41.79 
 
 
80 aa  53.9  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1557  glutaredoxin  49.25 
 
 
71 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  41.79 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  38.71 
 
 
86 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  39.39 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2308  glutaredoxin  49.25 
 
 
71 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  39.68 
 
 
81 aa  51.2  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  40.3 
 
 
80 aa  50.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  38.71 
 
 
88 aa  50.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  35.71 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  40.98 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3541  glutaredoxin 3  37.1 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4829  glutaredoxin 3  37.1 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.783956  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  33.93 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  37.7 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  37.1 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2100  glutaredoxin 3  35.48 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2144  glutaredoxin 3  35.48 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.737709  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  40.74 
 
 
78 aa  47.8  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2777  glutaredoxin 3  33.87 
 
 
102 aa  47  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  35.38 
 
 
76 aa  47.4  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  39.34 
 
 
85 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1547  glutaredoxin, GrxC  37.7 
 
 
96 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  42.11 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  38.89 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02541  glutaredoxin  37.7 
 
 
96 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  36.36 
 
 
86 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  39.34 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  39.34 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.73 
 
 
459 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  30.36 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  40.98 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  42.59 
 
 
92 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  39.29 
 
 
80 aa  44.3  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4197  glutaredoxin 3  35.48 
 
 
89 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4157  glutaredoxin 3  35.48 
 
 
89 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02081  glutaredoxin  34.43 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  45.45 
 
 
83 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  39.34 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2437  thioredoxin reductase  34.55 
 
 
442 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  38.89 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  39.34 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0519  glutaredoxin GrxC  40.74 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  31.25 
 
 
398 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  36.51 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  29.03 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  36.51 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  36.36 
 
 
86 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  32.26 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0829  glutaredoxin  38.98 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1149  glutaredoxin family protein  35.09 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2077  glutaredoxin  38.18 
 
 
229 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.622106  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00542  glutaredoxin 3 GrxC  35.48 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  31.15 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  38.89 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4078  glutaredoxin 3  32.26 
 
 
105 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378056 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  38.89 
 
 
85 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  41.67 
 
 
81 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1126  glutaredoxin 3  36.21 
 
 
92 aa  41.6  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0880684  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  30.65 
 
 
85 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1876  putative glutaredoxin 3  34.38 
 
 
90 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636189  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3815  YruB family glutaredoxin-like protein  34.48 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  35.71 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  41.38 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7595  glutaredoxin 3  37.04 
 
 
90 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  37.04 
 
 
86 aa  41.2  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  41.38 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0237  glutaredoxin 3  41.82 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  38.89 
 
 
89 aa  41.2  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  37.1 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2075  glutaredoxin  44.07 
 
 
79 aa  41.2  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2449  hypothetical protein  44.07 
 
 
79 aa  41.2  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  37.04 
 
 
175 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4091  glutaredoxin family protein  37.1 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2013  glutaredoxin GrxC  37.1 
 
 
88 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.319354  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  34.43 
 
 
243 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  35.48 
 
 
85 aa  40.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  30.91 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  30.65 
 
 
85 aa  40  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  35.48 
 
 
88 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  30.65 
 
 
85 aa  40  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4037  glutaredoxin family protein  37.1 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3729  glutaredoxin family protein  37.1 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3745  glutaredoxin family protein  37.1 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4003  glutaredoxin family protein  37.1 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4108  glutaredoxin family protein  37.1 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  38.89 
 
 
384 aa  40.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  31.67 
 
 
89 aa  40  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  36.36 
 
 
95 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27371  glutaredoxin  32.73 
 
 
87 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>