36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2077 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2077  glutaredoxin  100 
 
 		 229 aa  440  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.622106  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37000  glutaredoxin-like protein  51.28 
 
 		 100 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0139462 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4712  glutaredoxin-like protein  52.56 
 
 		 105 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  40.32 
 
 		 79 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  40.91 
 
 		 83 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  39.71 
 
 		 86 aa  52.4  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09790  glutaredoxin-like protein  44.16 
 
 		 142 aa  51.2  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.602612  normal  0.0514825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  39.39 
 
 		 82 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  39.39 
 
 		 82 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  39.39 
 
 		 82 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  37.88 
 
 		 94 aa  48.9  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  33.8 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  37.14 
 
 		 80 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  37.88 
 
 		 79 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  37.88 
 
 		 81 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  35.8 
 
 		 80 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  34.85 
 
 		 86 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  33.33 
 
 		 78 aa  46.2  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  35.14 
 
 		 89 aa  46.2  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  34.15 
 
 		 88 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  33.9 
 
 		 85 aa  45.8  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0829  glutaredoxin  33.33 
 
 		 80 aa  46.2  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  32.91 
 
 		 83 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 82 aa  45.4  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  35.94 
 
 		 78 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  37.5 
 
 		 79 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  34.33 
 
 		 91 aa  45.1  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  33.82 
 
 		 93 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  31.15 
 
 		 105 aa  43.5  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  33.9 
 
 		 85 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  28.21 
 
 		 82 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2081  glutaredoxin  38.18 
 
 		 74 aa  42.4  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  31.82 
 
 		 83 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0602  glutaredoxin 3  28.33 
 
 		 91 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  31.65 
 
 		 92 aa  42  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  30.65 
 
 		 87 aa  41.6  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>