79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37000 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_37000  glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 100 aa  206  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0139462 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4712  glutaredoxin-like protein  62.65 
 
 		 105 aa  104  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2077  glutaredoxin  51.28 
 
 		 229 aa  86.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.622106  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09790  glutaredoxin-like protein  53.85 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.602612  normal  0.0514825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  42.47 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  44.62 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  35.53 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  37.5 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  37.5 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  36.71 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  36.25 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  41.67 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  33.77 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  36.25 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  36.25 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  34.29 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  36.51 
 
 		 243 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  38.46 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  32.05 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  35.21 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0413  glutaredoxin  38.03 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.584384 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  36.84 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  34.92 
 
 		 243 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  34.92 
 
 		 243 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  34.67 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  36.11 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  34.92 
 
 		 243 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  34.94 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5178  hypothetical protein  36.11 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0980177  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  37.88 
 
 		 238 aa  45.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0126  glutaredoxin-family domain protein  34.92 
 
 		 243 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.803703  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13221  glutaredoxin protein  34.57 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  33.9 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  32.76 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  32.43 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  27.03 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  35.21 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  30.56 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  32.79 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  33.77 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  32.79 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  32.2 
 
 		 85 aa  43.5  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  33.33 
 
 		 242 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  31.15 
 
 		 247 aa  43.5  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  31.15 
 
 		 247 aa  43.5  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3472  glutaredoxin family protein  29.51 
 
 		 243 aa  42.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.99974  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1796  glutaredoxin family protein  35.38 
 
 		 259 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193557  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  33.87 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  31.75 
 
 		 247 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  32.2 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8361  Glutaredoxin and related protein-like protein  35.71 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  36.67 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  35.85 
 
 		 247 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  31.75 
 
 		 242 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  25.88 
 
 		 391 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  36.17 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1547  glutaredoxin, GrxC  32.05 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02541  glutaredoxin  32.05 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  25 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  31.75 
 
 		 242 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  35.59 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  29.82 
 
 		 88 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  32.43 
 
 		 85 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  33.33 
 
 		 249 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  30 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  35.71 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  29 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  32.26 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2396  glutaredoxin  33.93 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.119438  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  27.78 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  27.4 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  29.33 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2689  YruB family glutaredoxin-like protein  30 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01971  glutaredoxin  29.03 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  35.71 
 
 		 85 aa  40  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  27.27 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0542  glutaredoxin  46.34 
 
 		 72 aa  40  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.695233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>