25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0542 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0542  glutaredoxin  100 
 
 
72 aa  146  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.695233  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  48.44 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  47.92 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  37.68 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0113  glutaredoxin  35.59 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2689  YruB family glutaredoxin-like protein  37.5 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  35.71 
 
 
247 aa  44.3  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4712  glutaredoxin-like protein  40 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  35.82 
 
 
81 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  38.71 
 
 
76 aa  42.7  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  43.48 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  40.38 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  40.68 
 
 
82 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4334  glutaredoxin  30.16 
 
 
78 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2081  glutaredoxin  38.46 
 
 
74 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  31.82 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  36.92 
 
 
80 aa  41.2  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  43.4 
 
 
73 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2230  glutaredoxin  38.18 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.381794  normal  0.448349 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2075  glutaredoxin  35 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  30.88 
 
 
84 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2449  hypothetical protein  35 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  30.67 
 
 
86 aa  40.4  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  35.09 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>