102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0179 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  100 
 
 		 86 aa  180  5.0000000000000004e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  68.67 
 
 		 88 aa  130  5e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  51.9 
 
 		 81 aa  94.4  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1753  glutaredoxin-like protein NrdH  46.25 
 
 		 80 aa  92.4  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0638832 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0095  glutaredoxin-like protein NrdH  50.6 
 
 		 83 aa  91.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3795  glutaredoxin-like protein NrdH  49.32 
 
 		 73 aa  90.5  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  50.68 
 
 		 73 aa  89.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3500  glutaredoxin-like protein NrdH  46.58 
 
 		 73 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  50.68 
 
 		 81 aa  88.2  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  46.84 
 
 		 79 aa  88.6  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  44.74 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  53.62 
 
 		 81 aa  86.3  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  47.95 
 
 		 73 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  48.61 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  48.61 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  50.7 
 
 		 81 aa  85.5  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  46.99 
 
 		 84 aa  85.1  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  48.61 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  48.61 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  48.61 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  48.61 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  48.61 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0970287 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  48.61 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  48.72 
 
 		 81 aa  84  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  47.22 
 
 		 79 aa  84  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  49.32 
 
 		 77 aa  84  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  48.57 
 
 		 79 aa  83.6  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  46.25 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  47.3 
 
 		 74 aa  82.8  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  41.1 
 
 		 73 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  46.58 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  42.03 
 
 		 78 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  42.03 
 
 		 78 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  42.03 
 
 		 78 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 		 81 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 		 81 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 		 81 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 		 81 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  39.73 
 
 		 73 aa  80.1  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  39.73 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  46.58 
 
 		 79 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  43.59 
 
 		 83 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  43.59 
 
 		 83 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  43.59 
 
 		 83 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3453  glutaredoxin-like protein NrdH  44.87 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24930  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  47.69 
 
 		 80 aa  77  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5535  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  46.48 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.038319  hitchhiker  0.0000122398 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  47.76 
 
 		 82 aa  76.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0354  glutaredoxin-like protein NrdH  43.48 
 
 		 74 aa  76.3  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  42.31 
 
 		 83 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  43.59 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  41.1 
 
 		 79 aa  73.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  42.47 
 
 		 76 aa  70.5  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0139  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  45.45 
 
 		 81 aa  67  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  43.48 
 
 		 77 aa  66.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  36.62 
 
 		 74 aa  65.1  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1014  glutaredoxin  38.81 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  37.14 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4274  glutaredoxin-like protein NrdH  46.03 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0324  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  38.89 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0101839  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1063  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  32.39 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290515  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4639  glutaredoxin  41.89 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  36.11 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4233  glutaredoxin  38.46 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00450128  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4400  glutaredoxin  39.74 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125164  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0880  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  28.57 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.121758  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2145  glutaredoxin  38.03 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201454  normal  0.150522 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2285  glutaredoxin  38.03 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.304987 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28890  hypothetical protein  33.77 
 
 		 285 aa  50.4  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  33.75 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3239  glutaredoxin  32.91 
 
 		 87 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0851867  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  36.36 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0451  hypothetical protein  40.38 
 
 		 255 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  32.35 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  32.5 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  32.5 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  38.98 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4052  glutaredoxin  38.71 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  35.85 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2369  glutaredoxin  36.92 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0319726  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  30.43 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  31.17 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  25.81 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  35.85 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  29.69 
 
 		 86 aa  42.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  30.59 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  26.92 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  31.75 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  29.49 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  30.88 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  35.29 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  35 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  26.87 
 
 		 76 aa  42  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  31.15 
 
 		 78 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  26.98 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  30.88 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  35.94 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  34.55 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  30 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>