45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28890 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_28890  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  44.87 
 
 		 81 aa  64.3  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1753  glutaredoxin-like protein NrdH  44.87 
 
 		 80 aa  64.7  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0638832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3500  glutaredoxin-like protein NrdH  44.16 
 
 		 73 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  45 
 
 		 81 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3795  glutaredoxin-like protein NrdH  42.86 
 
 		 73 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3453  glutaredoxin-like protein NrdH  40.96 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  42.5 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  41.77 
 
 		 77 aa  58.9  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  44.16 
 
 		 99 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4274  glutaredoxin-like protein NrdH  46.27 
 
 		 92 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0095  glutaredoxin-like protein NrdH  40.26 
 
 		 83 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  42.86 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  41.77 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  32.93 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  37.5 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  37.18 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  37.5 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  37.5 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  37.97 
 
 		 80 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  38.46 
 
 		 79 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  38.96 
 
 		 74 aa  55.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  43.84 
 
 		 81 aa  54.7  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4406  hypothetical protein  37.04 
 
 		 105 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  41.1 
 
 		 81 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  40.54 
 
 		 79 aa  53.5  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24930  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  40.85 
 
 		 80 aa  53.1  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  38.46 
 
 		 76 aa  53.1  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  39.24 
 
 		 79 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  35.8 
 
 		 82 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5535  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  36.71 
 
 		 81 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.038319  hitchhiker  0.0000122398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  37.08 
 
 		 98 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  30.38 
 
 		 78 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  37.35 
 
 		 83 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  30.38 
 
 		 78 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  30.38 
 
 		 78 aa  51.2  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  33.77 
 
 		 86 aa  50.8  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  36.84 
 
 		 73 aa  50.4  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  35.37 
 
 		 115 aa  50.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  36.36 
 
 		 73 aa  50.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0354  glutaredoxin-like protein NrdH  36 
 
 		 74 aa  48.5  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  36.36 
 
 		 73 aa  45.8  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  33.77 
 
 		 73 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4233  glutaredoxin  33.33 
 
 		 90 aa  43.9  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00450128  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1014  glutaredoxin  34.67 
 
 		 77 aa  42.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>