102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4923 on replicon NC_013442
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  100 
 
 		 80 aa  165  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  81.82 
 
 		 77 aa  130  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  74.68 
 
 		 82 aa  127  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  76.62 
 
 		 83 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  75.64 
 
 		 83 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  75.64 
 
 		 83 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  75.64 
 
 		 83 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  80.28 
 
 		 98 aa  123  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  73.08 
 
 		 81 aa  121  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  72 
 
 		 81 aa  120  9e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  70.89 
 
 		 79 aa  118  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  67.09 
 
 		 79 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1753  glutaredoxin-like protein NrdH  64 
 
 		 80 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0638832 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5535  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  65.38 
 
 		 81 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.038319  hitchhiker  0.0000122398 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  71.62 
 
 		 76 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  72.6 
 
 		 77 aa  110  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3453  glutaredoxin-like protein NrdH  65.38 
 
 		 81 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  62.03 
 
 		 81 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3500  glutaredoxin-like protein NrdH  61.64 
 
 		 73 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  61.64 
 
 		 73 aa  104  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  65.71 
 
 		 81 aa  103  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3795  glutaredoxin-like protein NrdH  60.27 
 
 		 73 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  63.01 
 
 		 73 aa  103  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  60.27 
 
 		 73 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  60.27 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  58.97 
 
 		 79 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  56.94 
 
 		 78 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  56.94 
 
 		 78 aa  102  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  56.94 
 
 		 78 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  64.38 
 
 		 99 aa  102  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  65.22 
 
 		 81 aa  103  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  61.64 
 
 		 73 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  57.53 
 
 		 78 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0095  glutaredoxin-like protein NrdH  56.25 
 
 		 83 aa  101  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  59.46 
 
 		 79 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  58.11 
 
 		 79 aa  98.6  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0354  glutaredoxin-like protein NrdH  55.41 
 
 		 74 aa  97.4  6e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  60.81 
 
 		 74 aa  95.5  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4274  glutaredoxin-like protein NrdH  63.64 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24930  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  60.29 
 
 		 80 aa  91.7  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  49.37 
 
 		 84 aa  89  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  50.63 
 
 		 81 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  50.63 
 
 		 81 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  50.63 
 
 		 81 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  50.63 
 
 		 81 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  50.63 
 
 		 81 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  46.91 
 
 		 81 aa  84.3  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  46.91 
 
 		 81 aa  84.3  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  46.91 
 
 		 81 aa  84.3  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  46.91 
 
 		 81 aa  84.3  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  46.91 
 
 		 81 aa  84.3  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  46.91 
 
 		 81 aa  84.3  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0970287 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  46.91 
 
 		 81 aa  84.3  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  48.61 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  46.25 
 
 		 86 aa  82.8  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  42.31 
 
 		 88 aa  81.3  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1014  glutaredoxin  45.83 
 
 		 77 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  45.21 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  41.43 
 
 		 74 aa  67  0.00000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  38.57 
 
 		 74 aa  62  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0880  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  43.28 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.121758  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0139  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  44.78 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1063  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  33.8 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290515  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2145  glutaredoxin  35 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201454  normal  0.150522 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2285  glutaredoxin  35 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.304987 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4639  glutaredoxin  40 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28890  hypothetical protein  37.97 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0324  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  31.94 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0101839  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4400  glutaredoxin  32.56 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125164  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4406  hypothetical protein  41.18 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4233  glutaredoxin  32.94 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00450128  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  33.77 
 
 		 81 aa  50.1  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  36.62 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  35.21 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  36.62 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  31.88 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4052  glutaredoxin  35.48 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  32.88 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  33.8 
 
 		 402 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  29.11 
 
 		 249 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  35.94 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  33.33 
 
 		 391 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  30.99 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  34.92 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  34.92 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0451  hypothetical protein  35.09 
 
 		 255 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  32.39 
 
 		 260 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  34.92 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  30.14 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  30.77 
 
 		 384 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  30.14 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  31.25 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3239  glutaredoxin  28.21 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0851867  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  32.81 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  32.35 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  32.35 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  34.92 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  27.94 
 
 		 168 aa  40.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  28.17 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  32.31 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>