64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4233 on replicon NC_008539
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008539  Arth_4233  glutaredoxin  100 
 
 		 90 aa  188  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00450128  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4400  glutaredoxin  84.71 
 
 		 88 aa  152  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125164  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4639  glutaredoxin  51.32 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0354  glutaredoxin-like protein NrdH  46.05 
 
 		 74 aa  65.5  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  41.98 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  41.03 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  42.86 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  44 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  41.03 
 
 		 73 aa  63.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  38.46 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  41.03 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  43.24 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  40.28 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  38.46 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5535  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  44.74 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.038319  hitchhiker  0.0000122398 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  37.18 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  37.04 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3795  glutaredoxin-like protein NrdH  40.28 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  39.74 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  37.5 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  41.33 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0095  glutaredoxin-like protein NrdH  37.93 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  39.29 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  38.46 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1753  glutaredoxin-like protein NrdH  37.33 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0638832 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  42.47 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  42.47 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  42.47 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  34.18 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  34.18 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  34.18 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  40 
 
 		 79 aa  57  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3500  glutaredoxin-like protein NrdH  38.89 
 
 		 73 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  38.46 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  39.02 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  34.67 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  40 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  36.9 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  34.09 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  42.47 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3453  glutaredoxin-like protein NrdH  37.18 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  41.33 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24930  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  38.03 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  32.94 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  35.9 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4274  glutaredoxin-like protein NrdH  38.36 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4406  hypothetical protein  33.7 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  33.33 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  33.33 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0970287 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28890  hypothetical protein  34.85 
 
 		 285 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2665  glutaredoxin  42.59 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  27.27 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  24.68 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  32.91 
 
 		 80 aa  40.8  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  29.41 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0451  hypothetical protein  35.19 
 
 		 255 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>