88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24930 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_24930  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  100 
 
 		 80 aa  163  8e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  70.27 
 
 		 79 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  67.95 
 
 		 79 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  66.67 
 
 		 81 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3453  glutaredoxin-like protein NrdH  67.61 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  68.18 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  65.75 
 
 		 83 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3500  glutaredoxin-like protein NrdH  66.67 
 
 		 73 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0095  glutaredoxin-like protein NrdH  66.22 
 
 		 83 aa  105  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  66.2 
 
 		 78 aa  104  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  66.2 
 
 		 98 aa  104  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  63.01 
 
 		 82 aa  103  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3795  glutaredoxin-like protein NrdH  63.77 
 
 		 73 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  61.97 
 
 		 79 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  63.77 
 
 		 77 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  65.22 
 
 		 81 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  63.01 
 
 		 83 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  61.97 
 
 		 79 aa  101  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  63.01 
 
 		 83 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  63.01 
 
 		 83 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  64.79 
 
 		 79 aa  101  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1753  glutaredoxin-like protein NrdH  60.87 
 
 		 80 aa  100  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0638832 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  59.15 
 
 		 78 aa  100  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  59.15 
 
 		 78 aa  100  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  59.15 
 
 		 78 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  66.15 
 
 		 81 aa  99.8  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  63.77 
 
 		 73 aa  98.2  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  66.67 
 
 		 81 aa  98.2  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  60.87 
 
 		 73 aa  96.7  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  62.32 
 
 		 99 aa  95.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  65.28 
 
 		 77 aa  93.6  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  58.9 
 
 		 80 aa  93.6  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  57.97 
 
 		 73 aa  92.8  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  57.97 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0354  glutaredoxin-like protein NrdH  57.14 
 
 		 74 aa  90.1  8e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5535  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  63.08 
 
 		 81 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.038319  hitchhiker  0.0000122398 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  60.87 
 
 		 73 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  60 
 
 		 74 aa  88.6  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4274  glutaredoxin-like protein NrdH  60.61 
 
 		 92 aa  87.8  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  55.07 
 
 		 76 aa  84.3  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  46.38 
 
 		 88 aa  84  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1014  glutaredoxin  54.79 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  46.38 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  41.77 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  39.44 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  39.44 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  39.44 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0970287 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  41.18 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  41.18 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  41.18 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  41.18 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  41.18 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  39.44 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  39.44 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  39.44 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  39.44 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  39.44 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4639  glutaredoxin  47.83 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  38.24 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0139  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  42.19 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  36.76 
 
 		 74 aa  57  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0324  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  37.14 
 
 		 73 aa  57  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0101839  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0880  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  35.29 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.121758  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4233  glutaredoxin  36.05 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00450128  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4400  glutaredoxin  36.49 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125164  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1063  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  36.23 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290515  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  37.14 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28890  hypothetical protein  40.54 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2145  glutaredoxin  36.11 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201454  normal  0.150522 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2285  glutaredoxin  36.11 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.304987 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4406  hypothetical protein  43.28 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2369  glutaredoxin  36.76 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0319726  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  37.66 
 
 		 81 aa  47  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  35.82 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  34.25 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  30.77 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  43.4 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  32.84 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  31.34 
 
 		 76 aa  42  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  45.24 
 
 		 80 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  45.24 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  29.17 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  31.08 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  32.84 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  29.63 
 
 		 84 aa  40.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  32.89 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0451  hypothetical protein  36 
 
 		 255 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  31.94 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>