92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2145 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2285  glutaredoxin  100 
 
 
83 aa  173  9e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304987 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2145  glutaredoxin  100 
 
 
83 aa  173  9e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201454  normal  0.150522 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  42.11 
 
 
81 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  43.06 
 
 
81 aa  63.9  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  39.47 
 
 
77 aa  62  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  44.44 
 
 
81 aa  62.4  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  39.47 
 
 
79 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3500  glutaredoxin-like protein NrdH  36.84 
 
 
73 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  33.33 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  33.33 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  33.33 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3795  glutaredoxin-like protein NrdH  35.53 
 
 
73 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0095  glutaredoxin-like protein NrdH  35.9 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  38.16 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  36.84 
 
 
81 aa  57  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  40.54 
 
 
98 aa  57  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  37.84 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  37.84 
 
 
83 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  37.84 
 
 
83 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  35 
 
 
80 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  34.21 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1753  glutaredoxin-like protein NrdH  34.21 
 
 
80 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0638832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  37.84 
 
 
83 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  32.89 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  39.74 
 
 
88 aa  55.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  34.21 
 
 
79 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  37.33 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  35.53 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  33.33 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  35.06 
 
 
81 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  35.06 
 
 
81 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  35.06 
 
 
81 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  35.06 
 
 
81 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0970287 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  35.06 
 
 
81 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24930  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  36.11 
 
 
80 aa  54.7  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  35.06 
 
 
81 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  35.06 
 
 
81 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  35.06 
 
 
81 aa  54.3  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  38.03 
 
 
86 aa  53.9  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  35.53 
 
 
73 aa  53.9  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  35.53 
 
 
74 aa  53.9  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  35.06 
 
 
73 aa  53.9  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  33.78 
 
 
74 aa  53.5  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4274  glutaredoxin-like protein NrdH  38.57 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  35.06 
 
 
84 aa  53.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  35.53 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  33.77 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  33.77 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  33.77 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  33.77 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  33.77 
 
 
81 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  33.78 
 
 
74 aa  52  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  32.89 
 
 
99 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  32.89 
 
 
73 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  31.58 
 
 
73 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3453  glutaredoxin-like protein NrdH  35.9 
 
 
81 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1014  glutaredoxin  31.17 
 
 
77 aa  50.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  31.58 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  30.77 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5535  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  32.91 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.038319  hitchhiker  0.0000122398 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0451  hypothetical protein  34.62 
 
 
255 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0139  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  31.88 
 
 
81 aa  45.1  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1063  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  34.62 
 
 
72 aa  44.3  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290515  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0354  glutaredoxin-like protein NrdH  30.26 
 
 
74 aa  44.3  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  36.21 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2689  YruB family glutaredoxin-like protein  36.25 
 
 
80 aa  43.5  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  33.73 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3897  glutaredoxin family protein  32.05 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3729  glutaredoxin family protein  32.05 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3745  glutaredoxin family protein  32.05 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4201  glutaredoxin family protein  32.05 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4037  glutaredoxin family protein  32.05 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141219  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0324  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  31.08 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0101839  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4639  glutaredoxin  34.78 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  45.45 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  38.33 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  39.29 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4108  glutaredoxin family protein  32.05 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4003  glutaredoxin family protein  32.05 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4091  glutaredoxin family protein  32.05 
 
 
78 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2369  glutaredoxin  32.88 
 
 
80 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0319726  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3085  arsenate reductase and related protein  38 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2457  glutaredoxin  34.48 
 
 
213 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393373  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  32.43 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1149  glutaredoxin family protein  30.77 
 
 
78 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  30.38 
 
 
124 aa  40.4  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  28.57 
 
 
78 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  27.03 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1167  glutaredoxin  40.38 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.957373  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1145  glutaredoxin  40.38 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  36.17 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  28.4 
 
 
81 aa  40  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>