101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1063 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1063  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  100 
 
 		 72 aa  151  4e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290515  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  60 
 
 		 74 aa  91.7  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0324  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  56.16 
 
 		 73 aa  89.4  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0101839  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  55.71 
 
 		 74 aa  87.4  6e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0139  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  53.85 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  51.39 
 
 		 76 aa  75.9  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0880  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  35.21 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.121758  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  37.14 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  37.14 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  37.14 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  37.14 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  37.14 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  37.14 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  37.14 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0970287 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  37.14 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  34.29 
 
 		 84 aa  63.5  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  34.29 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  34.29 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  34.29 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  34.29 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  34.29 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1753  glutaredoxin-like protein NrdH  36.62 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0638832 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  32.39 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  38.03 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  33.8 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  36.62 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  35.21 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  35.82 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  36.11 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  33.8 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  35.21 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  30.99 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  36.62 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  34.29 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  32.84 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  30.99 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  35.21 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  36.62 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0095  glutaredoxin-like protein NrdH  32.39 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  35.21 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3500  glutaredoxin-like protein NrdH  32.39 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24930  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  35.29 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  30.99 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  29.58 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  35.21 
 
 		 73 aa  53.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3795  glutaredoxin-like protein NrdH  29.58 
 
 		 73 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3453  glutaredoxin-like protein NrdH  32.39 
 
 		 81 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  31.94 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  31.94 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  31.94 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  35.21 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  32.39 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1014  glutaredoxin  33.8 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  27.14 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  33.8 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  32.86 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  36.62 
 
 		 384 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  25.71 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  36.11 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  28.57 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  28.57 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  28.57 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5535  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  28.17 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.038319  hitchhiker  0.0000122398 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  32.39 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  35.21 
 
 		 383 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  35.21 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  30.99 
 
 		 81 aa  47.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  32.84 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  33.8 
 
 		 402 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  40.32 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  31.34 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0567  arsenate reductase and related  47.22 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2934  arsenate reductase and related  35.29 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0130498  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2145  glutaredoxin  34.62 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201454  normal  0.150522 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2285  glutaredoxin  34.62 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.304987 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0702  transcriptional regulator Spx  47.22 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0354  glutaredoxin-like protein NrdH  28.17 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  32.88 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  32.39 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  30.99 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1145  glutaredoxin  36.54 
 
 		 77 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1167  glutaredoxin  36.54 
 
 		 77 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.957373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1309  transcriptional regulator Spx  40 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516979  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0996  transcriptional regulator Spx  35.56 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00113345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1109  transcriptional regulator Spx  40 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1091  transcriptional regulator Spx  40 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1085  transcriptional regulator Spx  40 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1200  transcriptional regulator Spx  40 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1704  arsenate reductase  37.78 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0904  transcriptional regulator Spx  40 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.873656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1347  transcriptional regulator Spx  40 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0109883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1242  transcriptional regulator Spx  40 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4100  transcriptional regulator Spx  40 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1270  transcriptional regulator Spx  40 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  27.69 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4052  glutaredoxin  30.65 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  26.87 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3239  glutaredoxin  27.78 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0851867  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1359  arsenate reductase  35.56 
 
 		 133 aa  40  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00176431  normal  0.0126888 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0078  transcriptional regulator Spx  28.89 
 
 		 132 aa  40  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>