75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4274 on replicon NC_014159
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014159  Tpau_4274  glutaredoxin-like protein NrdH  100 
 
 		 92 aa  187  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  66.67 
 
 		 77 aa  115  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  67.11 
 
 		 82 aa  114  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5535  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  71.62 
 
 		 81 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.038319  hitchhiker  0.0000122398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  70 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  67.61 
 
 		 77 aa  110  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  67.61 
 
 		 83 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  67.61 
 
 		 83 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  68.06 
 
 		 79 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  67.61 
 
 		 83 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  66.67 
 
 		 83 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  69.44 
 
 		 81 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  64.38 
 
 		 81 aa  106  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  64.38 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  64.47 
 
 		 80 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  61.97 
 
 		 81 aa  96.3  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3500  glutaredoxin-like protein NrdH  61.97 
 
 		 73 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  59.72 
 
 		 81 aa  94.7  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3795  glutaredoxin-like protein NrdH  60.56 
 
 		 73 aa  94.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  60.27 
 
 		 76 aa  93.6  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  59.15 
 
 		 79 aa  93.6  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3453  glutaredoxin-like protein NrdH  58.33 
 
 		 81 aa  92.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24930  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  59.42 
 
 		 80 aa  91.7  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  60.87 
 
 		 79 aa  91.3  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1753  glutaredoxin-like protein NrdH  54.93 
 
 		 80 aa  90.5  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0638832 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  54.79 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  50.7 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  54.93 
 
 		 73 aa  88.6  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  48.61 
 
 		 78 aa  88.2  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  48.61 
 
 		 78 aa  88.2  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  48.61 
 
 		 78 aa  88.2  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  55.71 
 
 		 79 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0354  glutaredoxin-like protein NrdH  56.52 
 
 		 74 aa  87  7e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  59.15 
 
 		 73 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  55.71 
 
 		 79 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0095  glutaredoxin-like protein NrdH  54.17 
 
 		 83 aa  85.5  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  54.93 
 
 		 73 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  53.42 
 
 		 73 aa  84.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  53.42 
 
 		 74 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  55.56 
 
 		 99 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1014  glutaredoxin  52.78 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4639  glutaredoxin  47.44 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  47.83 
 
 		 86 aa  71.2  0.000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  43.84 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4400  glutaredoxin  44.3 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125164  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28890  hypothetical protein  44.16 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  38.36 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  36.62 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2145  glutaredoxin  39.47 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201454  normal  0.150522 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  40.85 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2285  glutaredoxin  39.47 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.304987 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4233  glutaredoxin  40.51 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00450128  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  39.44 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  39.44 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  39.44 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  39.44 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  39.44 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  38.03 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4406  hypothetical protein  44.78 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  35.71 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  35.71 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  35.71 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0970287 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  35.71 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  35.71 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  35.71 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0880  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  37.14 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.121758  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  35.71 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  36.84 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0324  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  30.99 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0101839  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0139  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  34.33 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  34.21 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1063  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  30.43 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290515  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  27.5 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  32.08 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0451  hypothetical protein  29.23 
 
 		 255 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>