97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2421 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  100 
 
 		 77 aa  157  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  79.73 
 
 		 83 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  79.73 
 
 		 83 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  79.73 
 
 		 83 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  78.95 
 
 		 98 aa  123  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  79.17 
 
 		 81 aa  122  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  80.82 
 
 		 83 aa  123  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5535  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  78.87 
 
 		 81 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.038319  hitchhiker  0.0000122398 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  78.67 
 
 		 79 aa  122  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  77.33 
 
 		 82 aa  121  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  75.68 
 
 		 77 aa  119  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  72.6 
 
 		 80 aa  110  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  73.61 
 
 		 81 aa  110  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  71.62 
 
 		 81 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  74.29 
 
 		 81 aa  107  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4274  glutaredoxin-like protein NrdH  67.61 
 
 		 92 aa  106  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  72.22 
 
 		 79 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3453  glutaredoxin-like protein NrdH  69.33 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1753  glutaredoxin-like protein NrdH  66.22 
 
 		 80 aa  105  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0638832 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  66.67 
 
 		 79 aa  101  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3500  glutaredoxin-like protein NrdH  69.44 
 
 		 73 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0095  glutaredoxin-like protein NrdH  61.11 
 
 		 83 aa  100  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3795  glutaredoxin-like protein NrdH  65.28 
 
 		 73 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  67.57 
 
 		 76 aa  99.4  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  65.28 
 
 		 73 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  62.5 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  66.67 
 
 		 81 aa  95.5  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  62.5 
 
 		 73 aa  95.9  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  63.51 
 
 		 99 aa  94.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  59.46 
 
 		 79 aa  93.2  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  59.46 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0354  glutaredoxin-like protein NrdH  60.56 
 
 		 74 aa  92.8  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24930  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  66.67 
 
 		 80 aa  92.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  57.33 
 
 		 78 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  58.33 
 
 		 74 aa  91.3  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  53.33 
 
 		 78 aa  90.9  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  53.33 
 
 		 78 aa  90.9  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  53.33 
 
 		 78 aa  90.9  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  59.72 
 
 		 73 aa  88.2  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  59.72 
 
 		 73 aa  86.7  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1014  glutaredoxin  49.33 
 
 		 77 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  46.58 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  46.58 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  46.58 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  46.58 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  46.58 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  46.58 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  43.06 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  40.79 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  43.48 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4639  glutaredoxin  49.37 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  41.89 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0970287 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  41.89 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  41.89 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  41.89 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  41.89 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  41.89 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  41.89 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  41.89 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0880  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  42.25 
 
 		 73 aa  63.2  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.121758  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0139  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  42.03 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4400  glutaredoxin  40.51 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125164  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  36 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4233  glutaredoxin  43.24 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00450128  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4406  hypothetical protein  46.15 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  36 
 
 		 74 aa  60.1  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28890  hypothetical protein  41.77 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  38.36 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2285  glutaredoxin  38.16 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.304987 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2145  glutaredoxin  38.16 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201454  normal  0.150522 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0324  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  33.8 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0101839  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1063  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  32.39 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290515  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  32.89 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  36.11 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2449  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2075  glutaredoxin  33.33 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  34.67 
 
 		 384 aa  43.9  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  35.53 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  36.11 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  36.84 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  39.29 
 
 		 260 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  32.43 
 
 		 391 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  33.93 
 
 		 249 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0451  hypothetical protein  33.93 
 
 		 255 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  34.72 
 
 		 116 aa  40.8  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  32.35 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1149  glutaredoxin family protein  30.67 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  36.07 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  33.77 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  35.82 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  35.06 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4091  glutaredoxin family protein  30.67 
 
 		 78 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  34.62 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 85 aa  40  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3005  glutaredoxin 3  35.06 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3745  glutaredoxin family protein  30.67 
 
 		 78 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>