91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4375 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  100 
 
 		 73 aa  151  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  76.71 
 
 		 73 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  72.6 
 
 		 99 aa  115  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  67.12 
 
 		 73 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  67.12 
 
 		 115 aa  113  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3795  glutaredoxin-like protein NrdH  72.6 
 
 		 73 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3500  glutaredoxin-like protein NrdH  72.6 
 
 		 73 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  65.75 
 
 		 73 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  67.12 
 
 		 79 aa  111  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0354  glutaredoxin-like protein NrdH  62.5 
 
 		 74 aa  107  5e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  64.38 
 
 		 81 aa  107  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1753  glutaredoxin-like protein NrdH  63.01 
 
 		 80 aa  105  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0638832 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  61.64 
 
 		 80 aa  104  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3453  glutaredoxin-like protein NrdH  63.01 
 
 		 81 aa  102  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  58.9 
 
 		 78 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  56.94 
 
 		 78 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  56.94 
 
 		 78 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  56.94 
 
 		 78 aa  102  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  57.53 
 
 		 79 aa  101  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  57.53 
 
 		 79 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  63.89 
 
 		 82 aa  100  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  64.38 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  61.97 
 
 		 83 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  61.97 
 
 		 83 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  61.97 
 
 		 83 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  58.9 
 
 		 79 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0095  glutaredoxin-like protein NrdH  64.38 
 
 		 83 aa  98.6  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  60.27 
 
 		 77 aa  98.6  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  56.16 
 
 		 81 aa  97.8  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  59.42 
 
 		 81 aa  97.1  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  63.01 
 
 		 81 aa  96.7  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5535  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  63.38 
 
 		 81 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.038319  hitchhiker  0.0000122398 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  60.87 
 
 		 81 aa  95.9  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  56.94 
 
 		 83 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  57.75 
 
 		 98 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  56.76 
 
 		 74 aa  92.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  54.79 
 
 		 76 aa  90.9  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24930  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  61.76 
 
 		 80 aa  89.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  59.72 
 
 		 77 aa  86.7  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  49.32 
 
 		 84 aa  86.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  50 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  50 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  50 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  50 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0970287 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  50 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  50 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  47.95 
 
 		 86 aa  85.5  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  50 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1014  glutaredoxin  51.39 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  47.22 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  47.22 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  47.22 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  47.22 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  47.22 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  46.38 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4274  glutaredoxin-like protein NrdH  58.46 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  38.57 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  37.5 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4233  glutaredoxin  41.03 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00450128  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4639  glutaredoxin  45.71 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4400  glutaredoxin  39.74 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125164  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  37.5 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0139  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  39.39 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1063  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  30.99 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290515  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0880  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  29.85 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.121758  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2285  glutaredoxin  35.06 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.304987 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2145  glutaredoxin  35.06 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201454  normal  0.150522 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  39.06 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0324  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  32.88 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0101839  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  32.35 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4052  glutaredoxin  39.34 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  30.99 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  38.1 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  40 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28890  hypothetical protein  36.36 
 
 		 285 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  35.62 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  28.36 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  28.36 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  26.87 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4406  hypothetical protein  34.62 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3239  glutaredoxin  31.94 
 
 		 87 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0851867  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  35.48 
 
 		 242 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  30 
 
 		 82 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  38.1 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  30.77 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  24.32 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05131  putative arsenate reductase  29.69 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.129229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  36.62 
 
 		 391 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2369  glutaredoxin  36.76 
 
 		 80 aa  40  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0319726  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  27.94 
 
 		 116 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>