104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0521 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  100 
 
 		 73 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  76.71 
 
 		 73 aa  126  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  76.71 
 
 		 79 aa  119  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  68.49 
 
 		 73 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  68.49 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  67.12 
 
 		 73 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  72.6 
 
 		 81 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3500  glutaredoxin-like protein NrdH  68.49 
 
 		 73 aa  114  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3795  glutaredoxin-like protein NrdH  65.75 
 
 		 73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1753  glutaredoxin-like protein NrdH  65.75 
 
 		 80 aa  110  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0638832 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  65.75 
 
 		 99 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  65.75 
 
 		 79 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3453  glutaredoxin-like protein NrdH  67.12 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  61.11 
 
 		 78 aa  104  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  61.11 
 
 		 78 aa  104  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  61.11 
 
 		 78 aa  104  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0095  glutaredoxin-like protein NrdH  68.49 
 
 		 83 aa  105  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  58.9 
 
 		 78 aa  104  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  60.27 
 
 		 81 aa  104  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  63.01 
 
 		 77 aa  103  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0354  glutaredoxin-like protein NrdH  58.9 
 
 		 74 aa  103  8e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  63.01 
 
 		 80 aa  103  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  62.32 
 
 		 81 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  58.33 
 
 		 79 aa  100  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  58.33 
 
 		 79 aa  100  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  61.11 
 
 		 83 aa  100  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  58.9 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  61.11 
 
 		 82 aa  98.2  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  63.01 
 
 		 81 aa  98.6  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  59.42 
 
 		 81 aa  97.8  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24930  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  63.24 
 
 		 80 aa  97.4  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  59.15 
 
 		 83 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  59.15 
 
 		 83 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  59.15 
 
 		 83 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5535  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  59.72 
 
 		 81 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.038319  hitchhiker  0.0000122398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  59.15 
 
 		 98 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  56.76 
 
 		 74 aa  94  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  54.79 
 
 		 76 aa  90.9  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  50.68 
 
 		 86 aa  89.7  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  59.72 
 
 		 77 aa  88.2  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  48.61 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  47.95 
 
 		 88 aa  86.7  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  51.35 
 
 		 81 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  51.35 
 
 		 81 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  51.35 
 
 		 81 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  51.35 
 
 		 81 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  51.35 
 
 		 81 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  45.83 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0970287 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  45.83 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1014  glutaredoxin  48.61 
 
 		 77 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4274  glutaredoxin-like protein NrdH  53.73 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  41.1 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4639  glutaredoxin  44.74 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  36.62 
 
 		 74 aa  62  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4400  glutaredoxin  42.31 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125164  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4233  glutaredoxin  41.03 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00450128  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0139  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  39.39 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  36.92 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1063  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  35.21 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290515  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0324  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  37.5 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0101839  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0880  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  29.23 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.121758  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2145  glutaredoxin  35.53 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201454  normal  0.150522 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2285  glutaredoxin  35.53 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.304987 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  40.62 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  32.35 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  36.76 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  35.94 
 
 		 92 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  34.67 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  34.29 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  36.99 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  34.67 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  35.29 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28890  hypothetical protein  33.77 
 
 		 285 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  34.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4406  hypothetical protein  37.66 
 
 		 105 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  30.88 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  35.29 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4052  glutaredoxin  36.07 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  31.17 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0451  hypothetical protein  34.48 
 
 		 255 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  38.18 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  31.51 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2075  glutaredoxin  37.04 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2449  hypothetical protein  37.04 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3239  glutaredoxin  31.94 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0851867  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  28.36 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  28.36 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  40.91 
 
 		 391 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  34.92 
 
 		 86 aa  41.2  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3815  YruB family glutaredoxin-like protein  31.94 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  33.87 
 
 		 242 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  34.38 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2369  glutaredoxin  35.29 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0319726  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  32.81 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>