87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0446 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  100 
 
 
81 aa  167  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  80.52 
 
 
77 aa  133  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  79.17 
 
 
77 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  73.08 
 
 
80 aa  121  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  72.37 
 
 
82 aa  120  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  73.33 
 
 
83 aa  120  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  73.33 
 
 
83 aa  120  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  73.33 
 
 
83 aa  120  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  72.73 
 
 
83 aa  120  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  76.06 
 
 
98 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  73.97 
 
 
79 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  69.14 
 
 
81 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  71.79 
 
 
79 aa  116  9e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5535  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  76.12 
 
 
81 aa  114  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.038319  hitchhiker  0.0000122398 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3795  glutaredoxin-like protein NrdH  69.86 
 
 
73 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3500  glutaredoxin-like protein NrdH  69.86 
 
 
73 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1753  glutaredoxin-like protein NrdH  63.64 
 
 
80 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0638832 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3453  glutaredoxin-like protein NrdH  72.6 
 
 
81 aa  111  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  61.73 
 
 
81 aa  107  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  64.1 
 
 
79 aa  104  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  65.71 
 
 
81 aa  103  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  65.75 
 
 
76 aa  103  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0095  glutaredoxin-like protein NrdH  60.81 
 
 
83 aa  103  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  65.75 
 
 
73 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  63.01 
 
 
73 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  63.01 
 
 
115 aa  101  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  53.25 
 
 
78 aa  99.4  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  53.25 
 
 
78 aa  99.4  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4274  glutaredoxin-like protein NrdH  69.7 
 
 
92 aa  99.8  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  53.25 
 
 
78 aa  99.4  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  64.38 
 
 
99 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  56.58 
 
 
78 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  63.01 
 
 
73 aa  98.6  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0354  glutaredoxin-like protein NrdH  58.9 
 
 
74 aa  96.7  9e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  63.01 
 
 
73 aa  96.7  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  62.32 
 
 
81 aa  96.7  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24930  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  66.18 
 
 
80 aa  96.7  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  51.9 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  51.9 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  62.16 
 
 
74 aa  91.3  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  48.72 
 
 
86 aa  84  6e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  42.86 
 
 
88 aa  78.6  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1014  glutaredoxin  47.22 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  44.44 
 
 
81 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  44.44 
 
 
81 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  44.44 
 
 
81 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  44.44 
 
 
81 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  44.44 
 
 
81 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  41.98 
 
 
84 aa  71.2  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  38.89 
 
 
81 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  38.89 
 
 
81 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  38.89 
 
 
81 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0970287 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  38.89 
 
 
81 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  38.89 
 
 
81 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  38.89 
 
 
81 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  38.89 
 
 
81 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  38.89 
 
 
81 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  38.57 
 
 
74 aa  63.9  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  38.57 
 
 
74 aa  63.5  0.0000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28890  hypothetical protein  45 
 
 
285 aa  61.6  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998422  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0880  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  40 
 
 
73 aa  61.6  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.121758  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  37.5 
 
 
76 aa  57  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4406  hypothetical protein  41.77 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4639  glutaredoxin  44.29 
 
 
88 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2145  glutaredoxin  35.53 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201454  normal  0.150522 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2285  glutaredoxin  35.53 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304987 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0139  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  37.88 
 
 
81 aa  53.9  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4400  glutaredoxin  39.74 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125164  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0324  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  34.72 
 
 
73 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0101839  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  33.33 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4233  glutaredoxin  41.33 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00450128  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1063  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  30.99 
 
 
72 aa  47.8  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290515  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  33.78 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  34.78 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2369  glutaredoxin  36.49 
 
 
80 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0319726  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  35.94 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  31.51 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  36 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  29.33 
 
 
77 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  29.33 
 
 
77 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  31.51 
 
 
84 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  31.51 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  31.15 
 
 
249 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  29.33 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4052  glutaredoxin  33.33 
 
 
88 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  32.81 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  31.88 
 
 
116 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>