91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4052 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4052  glutaredoxin  100 
 
 		 88 aa  183  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3239  glutaredoxin  71.95 
 
 		 87 aa  136  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0851867  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2075  glutaredoxin  52.63 
 
 		 79 aa  94  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2449  hypothetical protein  52.63 
 
 		 79 aa  94  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  43.59 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  38.46 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  46.88 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  32.39 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  35.38 
 
 		 82 aa  52  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  31.25 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  34.15 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  31.43 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  37.33 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  34.62 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  38.46 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  31.58 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  31.58 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  31.58 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  38.71 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  42.11 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  33.33 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  33.33 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  38.71 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  33.33 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  39.34 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  35.48 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  35.71 
 
 		 175 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  35.44 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  44.26 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  35.37 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  42.86 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  31.75 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  38.71 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  31.88 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  36.07 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  32 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  30.3 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2230  glutaredoxin  48.72 
 
 		 87 aa  43.9  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.381794  normal  0.448349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  29.33 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  28.75 
 
 		 83 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  33.33 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18290  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  33.93 
 
 		 816 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  34.78 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1708  glutaredoxin  39.06 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.252246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  34.78 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1038  glutaredoxin-like protein  41.46 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  34.48 
 
 		 398 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  43.48 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  36.21 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  33.33 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  34.29 
 
 		 88 aa  42.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0707  glutaredoxin  45 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161206  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  32.26 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  31.15 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  38.98 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  30.26 
 
 		 88 aa  42  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  32.79 
 
 		 81 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  28.95 
 
 		 73 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  36.84 
 
 		 88 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  38.98 
 
 		 85 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  32.05 
 
 		 82 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  32.26 
 
 		 79 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  38.98 
 
 		 85 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  36.84 
 
 		 88 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  38.18 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  33.33 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0970287 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  33.33 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  27.69 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  29.69 
 
 		 245 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2124  glutaredoxin-like protein  42.86 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1063  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  30.65 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290515  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  33.77 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  25.35 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0865  glutaredoxin  22.81 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.765785  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  26.32 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  33.33 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  29.51 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0237  arsenate reductase and related  33.75 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.323435 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  31.75 
 
 		 242 aa  40.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1704  arsenate reductase  43.9 
 
 		 144 aa  40  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 87 aa  40  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 87 aa  40  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5135  arsenate reductase related protein  37.21 
 
 		 134 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  30.77 
 
 		 82 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>