96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3721 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  100 
 
 		 78 aa  161  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  82.89 
 
 		 78 aa  140  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  82.89 
 
 		 78 aa  140  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  82.89 
 
 		 78 aa  140  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  69.74 
 
 		 79 aa  122  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  68.42 
 
 		 79 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  67.57 
 
 		 79 aa  117  7.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1753  glutaredoxin-like protein NrdH  65.75 
 
 		 80 aa  116  7.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0638832 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  62.67 
 
 		 79 aa  113  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  64.38 
 
 		 81 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  59.74 
 
 		 81 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  62.5 
 
 		 83 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  58.9 
 
 		 77 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  60.81 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  60.81 
 
 		 83 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  60.81 
 
 		 83 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  60.81 
 
 		 83 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0095  glutaredoxin-like protein NrdH  62.16 
 
 		 83 aa  108  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0354  glutaredoxin-like protein NrdH  60.27 
 
 		 74 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3453  glutaredoxin-like protein NrdH  62.67 
 
 		 81 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3500  glutaredoxin-like protein NrdH  58.9 
 
 		 73 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  62.32 
 
 		 81 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  58.67 
 
 		 79 aa  106  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3795  glutaredoxin-like protein NrdH  58.9 
 
 		 73 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  56 
 
 		 82 aa  105  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  60.87 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  58.9 
 
 		 73 aa  104  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  60.27 
 
 		 99 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  58.9 
 
 		 73 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  57.53 
 
 		 73 aa  102  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  58.9 
 
 		 73 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24930  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  66.18 
 
 		 80 aa  102  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  57.53 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  57.53 
 
 		 80 aa  101  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  60.81 
 
 		 74 aa  100  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  56.58 
 
 		 81 aa  99  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5535  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  52.7 
 
 		 81 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.038319  hitchhiker  0.0000122398 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  57.33 
 
 		 77 aa  92  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  52.05 
 
 		 76 aa  89.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  44.74 
 
 		 86 aa  86.3  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1014  glutaredoxin  52.78 
 
 		 77 aa  84  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4274  glutaredoxin-like protein NrdH  53.85 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  40.54 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  44.44 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0970287 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  45.83 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  45.83 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  43.06 
 
 		 81 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  43.06 
 
 		 81 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  43.06 
 
 		 81 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  43.06 
 
 		 81 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  43.06 
 
 		 81 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4639  glutaredoxin  41.56 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  36.62 
 
 		 74 aa  63.5  0.0000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0880  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  35.71 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.121758  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  35.21 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  32.88 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4400  glutaredoxin  36 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125164  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0139  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  36.36 
 
 		 81 aa  57  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28890  hypothetical protein  32.93 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4233  glutaredoxin  34.67 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00450128  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  39.74 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2285  glutaredoxin  33.33 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.304987 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2145  glutaredoxin  33.33 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201454  normal  0.150522 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1063  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  29.58 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290515  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0324  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  30.56 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0101839  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4406  hypothetical protein  36.71 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  36.99 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  33.33 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  32 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  29.85 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  30 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  33.8 
 
 		 391 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2369  glutaredoxin  31.08 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0319726  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  36.21 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  30.88 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  37.31 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  35.82 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  34.48 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4052  glutaredoxin  31.15 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  30.77 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3239  glutaredoxin  29.33 
 
 		 87 aa  42  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0851867  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  25.97 
 
 		 84 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  31.08 
 
 		 82 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  32.88 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  32.81 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  27.4 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  32.05 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0451  hypothetical protein  32.73 
 
 		 255 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  31.75 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  32.86 
 
 		 80 aa  40  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>