91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0377 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0377  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  100 
 
 
74 aa  156  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10180  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  70.27 
 
 
81 aa  110  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521827  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3453  glutaredoxin-like protein NrdH  66.22 
 
 
81 aa  102  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0314  glutaredoxin-like protein nrdH  59.46 
 
 
73 aa  100  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24062  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3721  glutaredoxin-like protein NrdH  60.81 
 
 
78 aa  100  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75993  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2439  glutaredoxin-like protein NrdH  64.86 
 
 
79 aa  100  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354839  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1753  glutaredoxin-like protein NrdH  60.81 
 
 
80 aa  100  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0638832 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1119  glutaredoxin-like protein NrdH  58.9 
 
 
78 aa  99.4  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.556674  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1065  glutaredoxin-related protein NrdH  58.9 
 
 
78 aa  99.4  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0223724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3540  glutaredoxin-related protein NrdH  58.9 
 
 
78 aa  99.4  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00255736  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0290  glutaredoxin-like protein nrdH  59.46 
 
 
115 aa  99.4  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7384  glutaredoxin protein  60.81 
 
 
99 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.405165  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0354  glutaredoxin-like protein NrdH  60.81 
 
 
74 aa  99.4  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  59.46 
 
 
81 aa  98.2  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2952  glutaredoxin-like protein NrdH  58.11 
 
 
73 aa  98.6  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.794387  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0095  glutaredoxin-like protein NrdH  58.11 
 
 
83 aa  97.4  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3500  glutaredoxin-like protein NrdH  59.46 
 
 
73 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3291  glutaredoxin-like protein NrdH  63.51 
 
 
77 aa  97.1  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3795  glutaredoxin-like protein NrdH  59.46 
 
 
73 aa  97.1  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4923  glutaredoxin-like protein NrdH  60.81 
 
 
80 aa  95.5  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  57.53 
 
 
79 aa  95.5  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1148  glutaredoxin-like protein NrdH  56.16 
 
 
79 aa  94.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1862  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  61.11 
 
 
83 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1796  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  61.11 
 
 
83 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297213  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1815  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  61.11 
 
 
83 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389601  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0521  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  56.76 
 
 
73 aa  94  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.144081 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  56.94 
 
 
81 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  60.27 
 
 
83 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4375  glutaredoxin-like protein NrdH  56.76 
 
 
73 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0803  glutaredoxin-like protein NrdH  58.11 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.815074 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2421  glutaredoxin-like protein NrdH  58.33 
 
 
77 aa  91.3  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0446  glutaredoxin-like protein NrdH  62.16 
 
 
81 aa  91.3  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2971  glutaredoxin-like protein NrdH  57.53 
 
 
82 aa  90.9  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454074  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  59.72 
 
 
98 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  55.71 
 
 
81 aa  89.4  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13069  glutaredoxin-like electron transport protein nrdH  56.76 
 
 
79 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.193738 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5535  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  54.79 
 
 
81 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.038319  hitchhiker  0.0000122398 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24930  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  59.42 
 
 
80 aa  86.7  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  49.32 
 
 
84 aa  85.5  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  60.81 
 
 
76 aa  85.5  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  46.58 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  46.58 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0970287 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  46.58 
 
 
81 aa  82.8  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  46.58 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0109554 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  46.58 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  46.58 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  46.58 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  46.58 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0179  glutaredoxin  47.3 
 
 
86 aa  82.8  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  46.58 
 
 
81 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  46.58 
 
 
81 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  46.58 
 
 
81 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  46.58 
 
 
81 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  46.58 
 
 
81 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1460  glutaredoxin  41.89 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1014  glutaredoxin  57.53 
 
 
77 aa  79  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4274  glutaredoxin-like protein NrdH  56.72 
 
 
92 aa  77  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0880  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  45.45 
 
 
73 aa  65.1  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.121758  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0324  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  36.11 
 
 
73 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0101839  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4639  glutaredoxin  42.47 
 
 
88 aa  60.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0820  ribonucleoside-diphosphate reductase 2, NrdH-redoxin  34.72 
 
 
74 aa  60.8  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.959383  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1247  glutaredoxin  36.62 
 
 
74 aa  60.8  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000466466  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4233  glutaredoxin  39.74 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00450128  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  30.14 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1063  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  36.11 
 
 
72 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000290515  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28890  hypothetical protein  38.96 
 
 
285 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998422  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0139  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  34.85 
 
 
81 aa  56.2  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4400  glutaredoxin  37.18 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125164  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2285  glutaredoxin  35.53 
 
 
83 aa  53.9  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304987 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2145  glutaredoxin  35.53 
 
 
83 aa  53.9  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201454  normal  0.150522 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  37.68 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  37.33 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  33.33 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  38.98 
 
 
82 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0451  hypothetical protein  33.96 
 
 
255 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  40.68 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  38.98 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22520  glutaredoxin-like protein  37.7 
 
 
86 aa  43.9  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4052  glutaredoxin  33.33 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  33.33 
 
 
402 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  30.3 
 
 
84 aa  42.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  37.93 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  38.46 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  33.9 
 
 
384 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  36 
 
 
116 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4406  hypothetical protein  36.36 
 
 
105 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  37.93 
 
 
80 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1415  hypothetical protein  42.11 
 
 
274 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  36.21 
 
 
83 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  33.9 
 
 
86 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  33.9 
 
 
78 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>